Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I7

PIKFYVE, 1-phosphatidylinositol 3-phosphate 5-kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIKFYVEQ9Y2I7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIKFYVEQ9Y2I7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIKFYVEQ9Y2I7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIKFYVEQ9Y2I7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIKFYVEQ9Y2I7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIKFYVEQ9Y2I7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIKFYVEQ9Y2I7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PIKFYVEQ9Y2I7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIKFYVEQ9Y2I7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIKFYVEQ9Y2I7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIKFYVEQ9Y2I7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIKFYVEQ9Y2I7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PIKFYVEQ9Y2I7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIKFYVEQ9Y2I7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIKFYVEQ9Y2I7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIKFYVEQ9Y2I7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PIKFYVEQ9Y2I7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIKFYVEQ9Y2I7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIKFYVEQ9Y2I7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PIKFYVEQ9Y2I7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PIKFYVEQ9Y2I7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PIKFYVEQ9Y2I7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PIKFYVEQ9Y2I7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PIKFYVEQ9Y2I7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIKFYVEQ9Y2I7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIKFYVEQ9Y2I7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIKFYVEQ9Y2I7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIKFYVEQ9Y2I7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIKFYVEQ9Y2I7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIKFYVEQ9Y2I7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIKFYVEQ9Y2I7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIKFYVEQ9Y2I7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIKFYVEQ9Y2I7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIKFYVEQ9Y2I7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIKFYVEQ9Y2I7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIKFYVEQ9Y2I7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIKFYVEQ9Y2I7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIKFYVEQ9Y2I7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIKFYVEQ9Y2I7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIKFYVEQ9Y2I7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIKFYVEQ9Y2I7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIKFYVEQ9Y2I7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIKFYVEQ9Y2I7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIKFYVEQ9Y2I7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIKFYVEQ9Y2I7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIKFYVEQ9Y2I7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIKFYVEQ9Y2I7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIKFYVEQ9Y2I7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIKFYVEQ9Y2I7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIKFYVEQ9Y2I7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PIKFYVEQ9Y2I7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PIKFYVEQ9Y2I7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PIKFYVEQ9Y2I7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIKFYVEQ9Y2I7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIKFYVEQ9Y2I7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PIKFYVEQ9Y2I7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIKFYVEQ9Y2I7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PIKFYVEQ9Y2I7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PIKFYVEQ9Y2I7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PIKFYVEQ9Y2I7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PIKFYVEQ9Y2I7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PIKFYVEQ9Y2I7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIKFYVEQ9Y2I7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIKFYVEQ9Y2I7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIKFYVEQ9Y2I7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIKFYVEQ9Y2I7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIKFYVEQ9Y2I7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PIKFYVEQ9Y2I7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIKFYVEQ9Y2I7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIKFYVEQ9Y2I7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIKFYVEQ9Y2I7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIKFYVEQ9Y2I7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIKFYVEQ9Y2I7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIKFYVEQ9Y2I7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIKFYVEQ9Y2I7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIKFYVEQ9Y2I7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIKFYVEQ9Y2I7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIKFYVEQ9Y2I7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIKFYVEQ9Y2I7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PIKFYVEQ9Y2I7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIKFYVEQ9Y2I7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIKFYVEQ9Y2I7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIKFYVEQ9Y2I7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PIKFYVEQ9Y2I7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIKFYVEQ9Y2I7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIKFYVEQ9Y2I7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIKFYVEQ9Y2I7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIKFYVEQ9Y2I7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PIKFYVEQ9Y2I7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIKFYVEQ9Y2I7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIKFYVEQ9Y2I7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIKFYVEQ9Y2I7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIKFYVEQ9Y2I7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIKFYVEQ9Y2I7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIKFYVEQ9Y2I7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIKFYVEQ9Y2I7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIKFYVEQ9Y2I7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms