Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y234

LIPT1, Lipoyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT1Q9Y234 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIPT1Q9Y234 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIPT1Q9Y234 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LIPT1Q9Y234 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIPT1Q9Y234 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LIPT1Q9Y234 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIPT1Q9Y234 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIPT1Q9Y234 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIPT1Q9Y234 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIPT1Q9Y234 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LIPT1Q9Y234 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIPT1Q9Y234 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIPT1Q9Y234 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIPT1Q9Y234 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIPT1Q9Y234 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LIPT1Q9Y234 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIPT1Q9Y234 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIPT1Q9Y234 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIPT1Q9Y234 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIPT1Q9Y234 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIPT1Q9Y234 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LIPT1Q9Y234 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LIPT1Q9Y234 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIPT1Q9Y234 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIPT1Q9Y234 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIPT1Q9Y234 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LIPT1Q9Y234 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LIPT1Q9Y234 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LIPT1Q9Y234 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LIPT1Q9Y234 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIPT1Q9Y234 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LIPT1Q9Y234 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIPT1Q9Y234 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIPT1Q9Y234 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIPT1Q9Y234 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIPT1Q9Y234 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIPT1Q9Y234 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LIPT1Q9Y234 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIPT1Q9Y234 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIPT1Q9Y234 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIPT1Q9Y234 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIPT1Q9Y234 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIPT1Q9Y234 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIPT1Q9Y234 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LIPT1Q9Y234 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIPT1Q9Y234 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIPT1Q9Y234 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIPT1Q9Y234 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIPT1Q9Y234 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LIPT1Q9Y234 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIPT1Q9Y234 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIPT1Q9Y234 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIPT1Q9Y234 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIPT1Q9Y234 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LIPT1Q9Y234 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LIPT1Q9Y234 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIPT1Q9Y234 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIPT1Q9Y234 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LIPT1Q9Y234 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIPT1Q9Y234 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LIPT1Q9Y234 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIPT1Q9Y234 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIPT1Q9Y234 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIPT1Q9Y234 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIPT1Q9Y234 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LIPT1Q9Y234 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIPT1Q9Y234 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIPT1Q9Y234 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIPT1Q9Y234 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIPT1Q9Y234 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIPT1Q9Y234 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIPT1Q9Y234 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIPT1Q9Y234 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LIPT1Q9Y234 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIPT1Q9Y234 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIPT1Q9Y234 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIPT1Q9Y234 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIPT1Q9Y234 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIPT1Q9Y234 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIPT1Q9Y234 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIPT1Q9Y234 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIPT1Q9Y234 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIPT1Q9Y234 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIPT1Q9Y234 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIPT1Q9Y234 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIPT1Q9Y234 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIPT1Q9Y234 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LIPT1Q9Y234 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIPT1Q9Y234 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIPT1Q9Y234 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIPT1Q9Y234 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIPT1Q9Y234 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIPT1Q9Y234 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIPT1Q9Y234 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIPT1Q9Y234 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIPT1Q9Y234 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIPT1Q9Y234 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIPT1Q9Y234 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIPT1Q9Y234 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIPT1Q9Y234 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms