Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQN3

CHMP2B, Charged multivesicular body protein 2b, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2BQ9UQN3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHMP2BQ9UQN3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHMP2BQ9UQN3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP2BQ9UQN3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHMP2BQ9UQN3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP2BQ9UQN3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP2BQ9UQN3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP2BQ9UQN3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP2BQ9UQN3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP2BQ9UQN3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP2BQ9UQN3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHMP2BQ9UQN3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CHMP2BQ9UQN3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMP2BQ9UQN3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMP2BQ9UQN3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMP2BQ9UQN3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHMP2BQ9UQN3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHMP2BQ9UQN3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHMP2BQ9UQN3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHMP2BQ9UQN3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHMP2BQ9UQN3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHMP2BQ9UQN3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHMP2BQ9UQN3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHMP2BQ9UQN3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CHMP2BQ9UQN3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHMP2BQ9UQN3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHMP2BQ9UQN3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHMP2BQ9UQN3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMP2BQ9UQN3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMP2BQ9UQN3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMP2BQ9UQN3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMP2BQ9UQN3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMP2BQ9UQN3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMP2BQ9UQN3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP2BQ9UQN3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP2BQ9UQN3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMP2BQ9UQN3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMP2BQ9UQN3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP2BQ9UQN3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP2BQ9UQN3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP2BQ9UQN3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP2BQ9UQN3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMP2BQ9UQN3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMP2BQ9UQN3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMP2BQ9UQN3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMP2BQ9UQN3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMP2BQ9UQN3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMP2BQ9UQN3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMP2BQ9UQN3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMP2BQ9UQN3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMP2BQ9UQN3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMP2BQ9UQN3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMP2BQ9UQN3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMP2BQ9UQN3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMP2BQ9UQN3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMP2BQ9UQN3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHMP2BQ9UQN3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHMP2BQ9UQN3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHMP2BQ9UQN3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHMP2BQ9UQN3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHMP2BQ9UQN3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHMP2BQ9UQN3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CHMP2BQ9UQN3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHMP2BQ9UQN3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMP2BQ9UQN3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMP2BQ9UQN3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMP2BQ9UQN3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP2BQ9UQN3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP2BQ9UQN3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP2BQ9UQN3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMP2BQ9UQN3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP2BQ9UQN3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP2BQ9UQN3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP2BQ9UQN3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP2BQ9UQN3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMP2BQ9UQN3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP2BQ9UQN3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMP2BQ9UQN3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMP2BQ9UQN3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMP2BQ9UQN3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMP2BQ9UQN3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMP2BQ9UQN3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMP2BQ9UQN3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMP2BQ9UQN3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CHMP2BQ9UQN3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CHMP2BQ9UQN3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMP2BQ9UQN3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMP2BQ9UQN3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMP2BQ9UQN3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHMP2BQ9UQN3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHMP2BQ9UQN3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMP2BQ9UQN3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMP2BQ9UQN3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMP2BQ9UQN3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMP2BQ9UQN3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMP2BQ9UQN3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMP2BQ9UQN3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMP2BQ9UQN3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMP2BQ9UQN3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMP2BQ9UQN3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms