Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQC9

CLCA2, Calcium-activated chloride channel regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA2Q9UQC9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLCA2Q9UQC9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLCA2Q9UQC9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLCA2Q9UQC9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CLCA2Q9UQC9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLCA2Q9UQC9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCA2Q9UQC9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCA2Q9UQC9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCA2Q9UQC9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCA2Q9UQC9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLCA2Q9UQC9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLCA2Q9UQC9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLCA2Q9UQC9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLCA2Q9UQC9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLCA2Q9UQC9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLCA2Q9UQC9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLCA2Q9UQC9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLCA2Q9UQC9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLCA2Q9UQC9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCA2Q9UQC9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCA2Q9UQC9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCA2Q9UQC9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCA2Q9UQC9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCA2Q9UQC9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCA2Q9UQC9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCA2Q9UQC9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLCA2Q9UQC9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLCA2Q9UQC9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLCA2Q9UQC9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLCA2Q9UQC9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLCA2Q9UQC9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLCA2Q9UQC9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCA2Q9UQC9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCA2Q9UQC9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCA2Q9UQC9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCA2Q9UQC9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCA2Q9UQC9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCA2Q9UQC9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCA2Q9UQC9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCA2Q9UQC9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCA2Q9UQC9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCA2Q9UQC9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCA2Q9UQC9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCA2Q9UQC9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLCA2Q9UQC9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCA2Q9UQC9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCA2Q9UQC9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCA2Q9UQC9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCA2Q9UQC9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCA2Q9UQC9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCA2Q9UQC9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCA2Q9UQC9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCA2Q9UQC9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLCA2Q9UQC9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCA2Q9UQC9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCA2Q9UQC9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCA2Q9UQC9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCA2Q9UQC9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLCA2Q9UQC9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCA2Q9UQC9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLCA2Q9UQC9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCA2Q9UQC9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCA2Q9UQC9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCA2Q9UQC9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCA2Q9UQC9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCA2Q9UQC9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCA2Q9UQC9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCA2Q9UQC9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCA2Q9UQC9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCA2Q9UQC9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCA2Q9UQC9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCA2Q9UQC9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCA2Q9UQC9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLCA2Q9UQC9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCA2Q9UQC9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCA2Q9UQC9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCA2Q9UQC9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CLCA2Q9UQC9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCA2Q9UQC9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCA2Q9UQC9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCA2Q9UQC9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCA2Q9UQC9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCA2Q9UQC9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLCA2Q9UQC9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCA2Q9UQC9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCA2Q9UQC9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCA2Q9UQC9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCA2Q9UQC9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCA2Q9UQC9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCA2Q9UQC9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLCA2Q9UQC9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLCA2Q9UQC9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLCA2Q9UQC9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLCA2Q9UQC9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLCA2Q9UQC9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLCA2Q9UQC9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLCA2Q9UQC9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLCA2Q9UQC9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLCA2Q9UQC9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLCA2Q9UQC9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms