Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTNND2Q9UQB3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTNND2Q9UQB3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTNND2Q9UQB3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTNND2Q9UQB3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CTNND2Q9UQB3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTNND2Q9UQB3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTNND2Q9UQB3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTNND2Q9UQB3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTNND2Q9UQB3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTNND2Q9UQB3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CTNND2Q9UQB3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTNND2Q9UQB3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTNND2Q9UQB3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTNND2Q9UQB3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTNND2Q9UQB3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTNND2Q9UQB3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTNND2Q9UQB3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTNND2Q9UQB3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTNND2Q9UQB3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTNND2Q9UQB3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTNND2Q9UQB3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTNND2Q9UQB3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTNND2Q9UQB3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTNND2Q9UQB3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTNND2Q9UQB3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTNND2Q9UQB3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTNND2Q9UQB3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTNND2Q9UQB3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTNND2Q9UQB3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTNND2Q9UQB3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTNND2Q9UQB3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTNND2Q9UQB3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTNND2Q9UQB3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTNND2Q9UQB3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTNND2Q9UQB3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTNND2Q9UQB3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTNND2Q9UQB3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTNND2Q9UQB3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTNND2Q9UQB3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTNND2Q9UQB3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTNND2Q9UQB3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTNND2Q9UQB3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTNND2Q9UQB3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTNND2Q9UQB3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTNND2Q9UQB3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTNND2Q9UQB3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTNND2Q9UQB3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTNND2Q9UQB3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTNND2Q9UQB3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTNND2Q9UQB3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTNND2Q9UQB3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTNND2Q9UQB3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CTNND2Q9UQB3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTNND2Q9UQB3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTNND2Q9UQB3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTNND2Q9UQB3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CTNND2Q9UQB3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTNND2Q9UQB3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTNND2Q9UQB3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CTNND2Q9UQB3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTNND2Q9UQB3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTNND2Q9UQB3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTNND2Q9UQB3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTNND2Q9UQB3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTNND2Q9UQB3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTNND2Q9UQB3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTNND2Q9UQB3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTNND2Q9UQB3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTNND2Q9UQB3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTNND2Q9UQB3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTNND2Q9UQB3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTNND2Q9UQB3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTNND2Q9UQB3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CTNND2Q9UQB3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CTNND2Q9UQB3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CTNND2Q9UQB3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTNND2Q9UQB3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTNND2Q9UQB3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTNND2Q9UQB3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTNND2Q9UQB3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTNND2Q9UQB3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTNND2Q9UQB3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTNND2Q9UQB3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTNND2Q9UQB3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTNND2Q9UQB3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTNND2Q9UQB3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTNND2Q9UQB3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTNND2Q9UQB3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTNND2Q9UQB3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTNND2Q9UQB3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTNND2Q9UQB3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTNND2Q9UQB3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTNND2Q9UQB3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTNND2Q9UQB3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CTNND2Q9UQB3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTNND2Q9UQB3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTNND2Q9UQB3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTNND2Q9UQB3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTNND2Q9UQB3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms