Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ35

SRRM2, Serine/arginine repetitive matrix protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM2Q9UQ35 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM2Q9UQ35 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM2Q9UQ35 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM2Q9UQ35 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM2Q9UQ35 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM2Q9UQ35 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM2Q9UQ35 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM2Q9UQ35 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM2Q9UQ35 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM2Q9UQ35 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SRRM2Q9UQ35 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SRRM2Q9UQ35 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM2Q9UQ35 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM2Q9UQ35 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM2Q9UQ35 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM2Q9UQ35 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM2Q9UQ35 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM2Q9UQ35 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRRM2Q9UQ35 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM2Q9UQ35 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM2Q9UQ35 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM2Q9UQ35 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM2Q9UQ35 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM2Q9UQ35 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM2Q9UQ35 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM2Q9UQ35 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM2Q9UQ35 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM2Q9UQ35 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM2Q9UQ35 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM2Q9UQ35 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM2Q9UQ35 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM2Q9UQ35 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM2Q9UQ35 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM2Q9UQ35 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM2Q9UQ35 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM2Q9UQ35 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM2Q9UQ35 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM2Q9UQ35 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM2Q9UQ35 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM2Q9UQ35 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM2Q9UQ35 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM2Q9UQ35 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM2Q9UQ35 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM2Q9UQ35 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM2Q9UQ35 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM2Q9UQ35 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM2Q9UQ35 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM2Q9UQ35 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM2Q9UQ35 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM2Q9UQ35 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM2Q9UQ35 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM2Q9UQ35 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
SRRM2Q9UQ35 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM2Q9UQ35 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM2Q9UQ35 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRRM2Q9UQ35 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM2Q9UQ35 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM2Q9UQ35 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM2Q9UQ35 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM2Q9UQ35 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM2Q9UQ35 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM2Q9UQ35 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM2Q9UQ35 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM2Q9UQ35 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRRM2Q9UQ35 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM2Q9UQ35 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM2Q9UQ35 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM2Q9UQ35 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM2Q9UQ35 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM2Q9UQ35 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM2Q9UQ35 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SRRM2Q9UQ35 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM2Q9UQ35 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM2Q9UQ35 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM2Q9UQ35 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM2Q9UQ35 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM2Q9UQ35 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM2Q9UQ35 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRRM2Q9UQ35 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM2Q9UQ35 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM2Q9UQ35 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM2Q9UQ35 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM2Q9UQ35 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRRM2Q9UQ35 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM2Q9UQ35 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM2Q9UQ35 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SRRM2Q9UQ35 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRRM2Q9UQ35 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRRM2Q9UQ35 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRRM2Q9UQ35 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SRRM2Q9UQ35 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRRM2Q9UQ35 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRRM2Q9UQ35 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRRM2Q9UQ35 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRRM2Q9UQ35 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRRM2Q9UQ35 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SRRM2Q9UQ35 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRRM2Q9UQ35 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRRM2Q9UQ35 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SRRM2Q9UQ35 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 251.8 ms