Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW6

SATB2, DNA-binding protein SATB2, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB2Q9UPW6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SATB2Q9UPW6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SATB2Q9UPW6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SATB2Q9UPW6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SATB2Q9UPW6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SATB2Q9UPW6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SATB2Q9UPW6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SATB2Q9UPW6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SATB2Q9UPW6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SATB2Q9UPW6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SATB2Q9UPW6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SATB2Q9UPW6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SATB2Q9UPW6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SATB2Q9UPW6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SATB2Q9UPW6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SATB2Q9UPW6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SATB2Q9UPW6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SATB2Q9UPW6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SATB2Q9UPW6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SATB2Q9UPW6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SATB2Q9UPW6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SATB2Q9UPW6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SATB2Q9UPW6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SATB2Q9UPW6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SATB2Q9UPW6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SATB2Q9UPW6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SATB2Q9UPW6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SATB2Q9UPW6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SATB2Q9UPW6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SATB2Q9UPW6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SATB2Q9UPW6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SATB2Q9UPW6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SATB2Q9UPW6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SATB2Q9UPW6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SATB2Q9UPW6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SATB2Q9UPW6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SATB2Q9UPW6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SATB2Q9UPW6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SATB2Q9UPW6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SATB2Q9UPW6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SATB2Q9UPW6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SATB2Q9UPW6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SATB2Q9UPW6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SATB2Q9UPW6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SATB2Q9UPW6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SATB2Q9UPW6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SATB2Q9UPW6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SATB2Q9UPW6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SATB2Q9UPW6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SATB2Q9UPW6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SATB2Q9UPW6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SATB2Q9UPW6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SATB2Q9UPW6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SATB2Q9UPW6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SATB2Q9UPW6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SATB2Q9UPW6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SATB2Q9UPW6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SATB2Q9UPW6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SATB2Q9UPW6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SATB2Q9UPW6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SATB2Q9UPW6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SATB2Q9UPW6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SATB2Q9UPW6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SATB2Q9UPW6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SATB2Q9UPW6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SATB2Q9UPW6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SATB2Q9UPW6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SATB2Q9UPW6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SATB2Q9UPW6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SATB2Q9UPW6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SATB2Q9UPW6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SATB2Q9UPW6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SATB2Q9UPW6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SATB2Q9UPW6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SATB2Q9UPW6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SATB2Q9UPW6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SATB2Q9UPW6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SATB2Q9UPW6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SATB2Q9UPW6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SATB2Q9UPW6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SATB2Q9UPW6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SATB2Q9UPW6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SATB2Q9UPW6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SATB2Q9UPW6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SATB2Q9UPW6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SATB2Q9UPW6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SATB2Q9UPW6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SATB2Q9UPW6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SATB2Q9UPW6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SATB2Q9UPW6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SATB2Q9UPW6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SATB2Q9UPW6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SATB2Q9UPW6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SATB2Q9UPW6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SATB2Q9UPW6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SATB2Q9UPW6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SATB2Q9UPW6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SATB2Q9UPW6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SATB2Q9UPW6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SATB2Q9UPW6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms