Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNRC6BQ9UPQ9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNRC6BQ9UPQ9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TNRC6BQ9UPQ9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNRC6BQ9UPQ9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNRC6BQ9UPQ9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNRC6BQ9UPQ9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TNRC6BQ9UPQ9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNRC6BQ9UPQ9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNRC6BQ9UPQ9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNRC6BQ9UPQ9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNRC6BQ9UPQ9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNRC6BQ9UPQ9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNRC6BQ9UPQ9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNRC6BQ9UPQ9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNRC6BQ9UPQ9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TNRC6BQ9UPQ9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNRC6BQ9UPQ9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TNRC6BQ9UPQ9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNRC6BQ9UPQ9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNRC6BQ9UPQ9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNRC6BQ9UPQ9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNRC6BQ9UPQ9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNRC6BQ9UPQ9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNRC6BQ9UPQ9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNRC6BQ9UPQ9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNRC6BQ9UPQ9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNRC6BQ9UPQ9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNRC6BQ9UPQ9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNRC6BQ9UPQ9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNRC6BQ9UPQ9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNRC6BQ9UPQ9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNRC6BQ9UPQ9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNRC6BQ9UPQ9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNRC6BQ9UPQ9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNRC6BQ9UPQ9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TNRC6BQ9UPQ9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNRC6BQ9UPQ9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNRC6BQ9UPQ9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNRC6BQ9UPQ9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNRC6BQ9UPQ9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNRC6BQ9UPQ9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNRC6BQ9UPQ9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNRC6BQ9UPQ9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNRC6BQ9UPQ9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNRC6BQ9UPQ9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TNRC6BQ9UPQ9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNRC6BQ9UPQ9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNRC6BQ9UPQ9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNRC6BQ9UPQ9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNRC6BQ9UPQ9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNRC6BQ9UPQ9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNRC6BQ9UPQ9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNRC6BQ9UPQ9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNRC6BQ9UPQ9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNRC6BQ9UPQ9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNRC6BQ9UPQ9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNRC6BQ9UPQ9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNRC6BQ9UPQ9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNRC6BQ9UPQ9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TNRC6BQ9UPQ9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNRC6BQ9UPQ9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNRC6BQ9UPQ9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNRC6BQ9UPQ9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNRC6BQ9UPQ9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNRC6BQ9UPQ9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNRC6BQ9UPQ9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNRC6BQ9UPQ9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNRC6BQ9UPQ9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNRC6BQ9UPQ9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNRC6BQ9UPQ9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNRC6BQ9UPQ9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNRC6BQ9UPQ9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TNRC6BQ9UPQ9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNRC6BQ9UPQ9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNRC6BQ9UPQ9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNRC6BQ9UPQ9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TNRC6BQ9UPQ9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNRC6BQ9UPQ9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNRC6BQ9UPQ9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNRC6BQ9UPQ9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNRC6BQ9UPQ9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TNRC6BQ9UPQ9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNRC6BQ9UPQ9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNRC6BQ9UPQ9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNRC6BQ9UPQ9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNRC6BQ9UPQ9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNRC6BQ9UPQ9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNRC6BQ9UPQ9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNRC6BQ9UPQ9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TNRC6BQ9UPQ9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNRC6BQ9UPQ9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNRC6BQ9UPQ9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNRC6BQ9UPQ9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNRC6BQ9UPQ9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNRC6BQ9UPQ9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNRC6BQ9UPQ9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNRC6BQ9UPQ9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNRC6BQ9UPQ9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNRC6BQ9UPQ9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms