Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AGAP1Q9UPQ3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
AGAP1Q9UPQ3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AGAP1Q9UPQ3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AGAP1Q9UPQ3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AGAP1Q9UPQ3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
AGAP1Q9UPQ3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
AGAP1Q9UPQ3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
AGAP1Q9UPQ3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
AGAP1Q9UPQ3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
AGAP1Q9UPQ3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AGAP1Q9UPQ3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AGAP1Q9UPQ3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AGAP1Q9UPQ3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AGAP1Q9UPQ3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AGAP1Q9UPQ3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AGAP1Q9UPQ3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AGAP1Q9UPQ3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
AGAP1Q9UPQ3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AGAP1Q9UPQ3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AGAP1Q9UPQ3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AGAP1Q9UPQ3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AGAP1Q9UPQ3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AGAP1Q9UPQ3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AGAP1Q9UPQ3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
AGAP1Q9UPQ3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
AGAP1Q9UPQ3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
AGAP1Q9UPQ3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AGAP1Q9UPQ3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
AGAP1Q9UPQ3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AGAP1Q9UPQ3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AGAP1Q9UPQ3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AGAP1Q9UPQ3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
AGAP1Q9UPQ3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AGAP1Q9UPQ3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AGAP1Q9UPQ3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
AGAP1Q9UPQ3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AGAP1Q9UPQ3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AGAP1Q9UPQ3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
AGAP1Q9UPQ3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AGAP1Q9UPQ3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AGAP1Q9UPQ3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
AGAP1Q9UPQ3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
AGAP1Q9UPQ3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
AGAP1Q9UPQ3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
AGAP1Q9UPQ3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
AGAP1Q9UPQ3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
AGAP1Q9UPQ3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
AGAP1Q9UPQ3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AGAP1Q9UPQ3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
AGAP1Q9UPQ3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
AGAP1Q9UPQ3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
AGAP1Q9UPQ3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AGAP1Q9UPQ3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
AGAP1Q9UPQ3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
AGAP1Q9UPQ3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
AGAP1Q9UPQ3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AGAP1Q9UPQ3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AGAP1Q9UPQ3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AGAP1Q9UPQ3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AGAP1Q9UPQ3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
AGAP1Q9UPQ3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
AGAP1Q9UPQ3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
AGAP1Q9UPQ3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AGAP1Q9UPQ3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AGAP1Q9UPQ3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AGAP1Q9UPQ3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
AGAP1Q9UPQ3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
AGAP1Q9UPQ3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AGAP1Q9UPQ3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AGAP1Q9UPQ3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
AGAP1Q9UPQ3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AGAP1Q9UPQ3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AGAP1Q9UPQ3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AGAP1Q9UPQ3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AGAP1Q9UPQ3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AGAP1Q9UPQ3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AGAP1Q9UPQ3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AGAP1Q9UPQ3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AGAP1Q9UPQ3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AGAP1Q9UPQ3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
AGAP1Q9UPQ3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AGAP1Q9UPQ3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AGAP1Q9UPQ3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
AGAP1Q9UPQ3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AGAP1Q9UPQ3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
AGAP1Q9UPQ3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
AGAP1Q9UPQ3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AGAP1Q9UPQ3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
AGAP1Q9UPQ3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AGAP1Q9UPQ3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AGAP1Q9UPQ3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
AGAP1Q9UPQ3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AGAP1Q9UPQ3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AGAP1Q9UPQ3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AGAP1Q9UPQ3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AGAP1Q9UPQ3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AGAP1Q9UPQ3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
AGAP1Q9UPQ3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AGAP1Q9UPQ3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms