Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FZD1Q9UP38 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FZD1Q9UP38 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FZD1Q9UP38 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FZD1Q9UP38 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FZD1Q9UP38 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
FZD1Q9UP38 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
FZD1Q9UP38 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
FZD1Q9UP38 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
FZD1Q9UP38 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
FZD1Q9UP38 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
FZD1Q9UP38 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
FZD1Q9UP38 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
FZD1Q9UP38 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
FZD1Q9UP38 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FZD1Q9UP38 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FZD1Q9UP38 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
FZD1Q9UP38 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
FZD1Q9UP38 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FZD1Q9UP38 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FZD1Q9UP38 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FZD1Q9UP38 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FZD1Q9UP38 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
FZD1Q9UP38 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FZD1Q9UP38 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FZD1Q9UP38 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
FZD1Q9UP38 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FZD1Q9UP38 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
FZD1Q9UP38 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
FZD1Q9UP38 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
FZD1Q9UP38 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
FZD1Q9UP38 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FZD1Q9UP38 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FZD1Q9UP38 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FZD1Q9UP38 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FZD1Q9UP38 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
FZD1Q9UP38 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FZD1Q9UP38 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FZD1Q9UP38 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FZD1Q9UP38 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FZD1Q9UP38 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FZD1Q9UP38 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
FZD1Q9UP38 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
FZD1Q9UP38 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FZD1Q9UP38 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FZD1Q9UP38 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
FZD1Q9UP38 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FZD1Q9UP38 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FZD1Q9UP38 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
FZD1Q9UP38 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
FZD1Q9UP38 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
FZD1Q9UP38 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.37
FZD1Q9UP38 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FZD1Q9UP38 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FZD1Q9UP38 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FZD1Q9UP38 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
FZD1Q9UP38 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
FZD1Q9UP38 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FZD1Q9UP38 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FZD1Q9UP38 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FZD1Q9UP38 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FZD1Q9UP38 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FZD1Q9UP38 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FZD1Q9UP38 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FZD1Q9UP38 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
FZD1Q9UP38 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
FZD1Q9UP38 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
FZD1Q9UP38 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FZD1Q9UP38 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FZD1Q9UP38 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FZD1Q9UP38 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
FZD1Q9UP38 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FZD1Q9UP38 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FZD1Q9UP38 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
FZD1Q9UP38 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
FZD1Q9UP38 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FZD1Q9UP38 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FZD1Q9UP38 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FZD1Q9UP38 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FZD1Q9UP38 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FZD1Q9UP38 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
FZD1Q9UP38 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FZD1Q9UP38 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FZD1Q9UP38 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FZD1Q9UP38 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FZD1Q9UP38 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FZD1Q9UP38 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FZD1Q9UP38 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FZD1Q9UP38 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
FZD1Q9UP38 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FZD1Q9UP38 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FZD1Q9UP38 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
FZD1Q9UP38 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
FZD1Q9UP38 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
FZD1Q9UP38 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FZD1Q9UP38 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
FZD1Q9UP38 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
FZD1Q9UP38 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
FZD1Q9UP38 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FZD1Q9UP38 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms