Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ3

BARX2, Homeobox protein BarH-like 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX2Q9UMQ3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BARX2Q9UMQ3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BARX2Q9UMQ3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BARX2Q9UMQ3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BARX2Q9UMQ3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BARX2Q9UMQ3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BARX2Q9UMQ3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BARX2Q9UMQ3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BARX2Q9UMQ3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
BARX2Q9UMQ3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BARX2Q9UMQ3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BARX2Q9UMQ3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BARX2Q9UMQ3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BARX2Q9UMQ3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BARX2Q9UMQ3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BARX2Q9UMQ3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BARX2Q9UMQ3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BARX2Q9UMQ3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BARX2Q9UMQ3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BARX2Q9UMQ3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
BARX2Q9UMQ3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BARX2Q9UMQ3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BARX2Q9UMQ3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BARX2Q9UMQ3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BARX2Q9UMQ3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BARX2Q9UMQ3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BARX2Q9UMQ3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BARX2Q9UMQ3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BARX2Q9UMQ3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BARX2Q9UMQ3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BARX2Q9UMQ3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
BARX2Q9UMQ3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BARX2Q9UMQ3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BARX2Q9UMQ3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BARX2Q9UMQ3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BARX2Q9UMQ3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BARX2Q9UMQ3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BARX2Q9UMQ3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
BARX2Q9UMQ3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BARX2Q9UMQ3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BARX2Q9UMQ3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BARX2Q9UMQ3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BARX2Q9UMQ3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BARX2Q9UMQ3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BARX2Q9UMQ3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BARX2Q9UMQ3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BARX2Q9UMQ3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BARX2Q9UMQ3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BARX2Q9UMQ3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BARX2Q9UMQ3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BARX2Q9UMQ3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BARX2Q9UMQ3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BARX2Q9UMQ3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BARX2Q9UMQ3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BARX2Q9UMQ3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
BARX2Q9UMQ3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BARX2Q9UMQ3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BARX2Q9UMQ3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BARX2Q9UMQ3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BARX2Q9UMQ3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BARX2Q9UMQ3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
BARX2Q9UMQ3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BARX2Q9UMQ3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BARX2Q9UMQ3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BARX2Q9UMQ3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BARX2Q9UMQ3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BARX2Q9UMQ3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BARX2Q9UMQ3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BARX2Q9UMQ3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BARX2Q9UMQ3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BARX2Q9UMQ3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BARX2Q9UMQ3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
BARX2Q9UMQ3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BARX2Q9UMQ3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BARX2Q9UMQ3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BARX2Q9UMQ3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
BARX2Q9UMQ3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BARX2Q9UMQ3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BARX2Q9UMQ3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BARX2Q9UMQ3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BARX2Q9UMQ3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BARX2Q9UMQ3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BARX2Q9UMQ3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BARX2Q9UMQ3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BARX2Q9UMQ3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BARX2Q9UMQ3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BARX2Q9UMQ3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BARX2Q9UMQ3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BARX2Q9UMQ3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BARX2Q9UMQ3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BARX2Q9UMQ3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BARX2Q9UMQ3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
BARX2Q9UMQ3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BARX2Q9UMQ3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BARX2Q9UMQ3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
BARX2Q9UMQ3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
BARX2Q9UMQ3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BARX2Q9UMQ3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BARX2Q9UMQ3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
BARX2Q9UMQ3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms