Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULX5

RNF112, RING finger protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF112Q9ULX5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF112Q9ULX5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF112Q9ULX5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF112Q9ULX5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF112Q9ULX5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF112Q9ULX5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF112Q9ULX5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF112Q9ULX5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF112Q9ULX5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF112Q9ULX5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF112Q9ULX5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF112Q9ULX5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF112Q9ULX5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF112Q9ULX5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF112Q9ULX5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF112Q9ULX5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF112Q9ULX5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF112Q9ULX5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF112Q9ULX5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF112Q9ULX5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RNF112Q9ULX5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF112Q9ULX5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF112Q9ULX5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF112Q9ULX5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF112Q9ULX5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF112Q9ULX5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RNF112Q9ULX5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF112Q9ULX5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF112Q9ULX5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RNF112Q9ULX5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF112Q9ULX5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF112Q9ULX5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF112Q9ULX5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RNF112Q9ULX5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF112Q9ULX5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RNF112Q9ULX5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RNF112Q9ULX5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RNF112Q9ULX5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF112Q9ULX5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF112Q9ULX5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF112Q9ULX5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF112Q9ULX5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF112Q9ULX5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF112Q9ULX5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF112Q9ULX5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF112Q9ULX5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF112Q9ULX5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF112Q9ULX5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF112Q9ULX5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF112Q9ULX5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF112Q9ULX5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF112Q9ULX5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF112Q9ULX5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF112Q9ULX5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF112Q9ULX5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF112Q9ULX5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF112Q9ULX5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF112Q9ULX5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF112Q9ULX5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF112Q9ULX5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF112Q9ULX5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RNF112Q9ULX5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RNF112Q9ULX5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF112Q9ULX5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF112Q9ULX5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF112Q9ULX5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF112Q9ULX5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RNF112Q9ULX5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF112Q9ULX5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF112Q9ULX5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF112Q9ULX5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RNF112Q9ULX5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF112Q9ULX5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF112Q9ULX5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF112Q9ULX5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RNF112Q9ULX5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF112Q9ULX5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF112Q9ULX5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF112Q9ULX5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF112Q9ULX5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF112Q9ULX5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RNF112Q9ULX5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF112Q9ULX5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF112Q9ULX5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF112Q9ULX5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF112Q9ULX5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF112Q9ULX5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RNF112Q9ULX5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF112Q9ULX5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF112Q9ULX5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF112Q9ULX5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF112Q9ULX5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF112Q9ULX5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF112Q9ULX5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RNF112Q9ULX5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF112Q9ULX5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF112Q9ULX5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF112Q9ULX5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF112Q9ULX5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RNF112Q9ULX5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms