Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ZNRF3Q9ULT6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ZNRF3Q9ULT6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ZNRF3Q9ULT6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
ZNRF3Q9ULT6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
ZNRF3Q9ULT6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ZNRF3Q9ULT6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ZNRF3Q9ULT6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ZNRF3Q9ULT6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
ZNRF3Q9ULT6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ZNRF3Q9ULT6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ZNRF3Q9ULT6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ZNRF3Q9ULT6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ZNRF3Q9ULT6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ZNRF3Q9ULT6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ZNRF3Q9ULT6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ZNRF3Q9ULT6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ZNRF3Q9ULT6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ZNRF3Q9ULT6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ZNRF3Q9ULT6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ZNRF3Q9ULT6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ZNRF3Q9ULT6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ZNRF3Q9ULT6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ZNRF3Q9ULT6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ZNRF3Q9ULT6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ZNRF3Q9ULT6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ZNRF3Q9ULT6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ZNRF3Q9ULT6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
ZNRF3Q9ULT6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ZNRF3Q9ULT6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ZNRF3Q9ULT6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ZNRF3Q9ULT6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ZNRF3Q9ULT6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ZNRF3Q9ULT6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
ZNRF3Q9ULT6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ZNRF3Q9ULT6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ZNRF3Q9ULT6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZNRF3Q9ULT6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ZNRF3Q9ULT6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ZNRF3Q9ULT6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
ZNRF3Q9ULT6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
ZNRF3Q9ULT6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ZNRF3Q9ULT6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ZNRF3Q9ULT6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ZNRF3Q9ULT6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ZNRF3Q9ULT6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
ZNRF3Q9ULT6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ZNRF3Q9ULT6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ZNRF3Q9ULT6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ZNRF3Q9ULT6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ZNRF3Q9ULT6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ZNRF3Q9ULT6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ZNRF3Q9ULT6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ZNRF3Q9ULT6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
ZNRF3Q9ULT6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC30.7■■■□□ 2.51
ZNRF3Q9ULT6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
ZNRF3Q9ULT6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
ZNRF3Q9ULT6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ZNRF3Q9ULT6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
ZNRF3Q9ULT6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ZNRF3Q9ULT6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ZNRF3Q9ULT6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ZNRF3Q9ULT6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ZNRF3Q9ULT6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ZNRF3Q9ULT6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ZNRF3Q9ULT6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ZNRF3Q9ULT6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ZNRF3Q9ULT6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ZNRF3Q9ULT6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ZNRF3Q9ULT6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ZNRF3Q9ULT6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ZNRF3Q9ULT6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ZNRF3Q9ULT6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
ZNRF3Q9ULT6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ZNRF3Q9ULT6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ZNRF3Q9ULT6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ZNRF3Q9ULT6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ZNRF3Q9ULT6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ZNRF3Q9ULT6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
ZNRF3Q9ULT6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ZNRF3Q9ULT6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ZNRF3Q9ULT6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ZNRF3Q9ULT6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ZNRF3Q9ULT6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ZNRF3Q9ULT6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ZNRF3Q9ULT6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ZNRF3Q9ULT6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ZNRF3Q9ULT6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ZNRF3Q9ULT6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ZNRF3Q9ULT6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
ZNRF3Q9ULT6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ZNRF3Q9ULT6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ZNRF3Q9ULT6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ZNRF3Q9ULT6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
ZNRF3Q9ULT6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ZNRF3Q9ULT6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ZNRF3Q9ULT6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ZNRF3Q9ULT6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ZNRF3Q9ULT6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms