Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PNMA2Q9UL42 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PNMA2Q9UL42 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PNMA2Q9UL42 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PNMA2Q9UL42 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PNMA2Q9UL42 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PNMA2Q9UL42 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PNMA2Q9UL42 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PNMA2Q9UL42 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PNMA2Q9UL42 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PNMA2Q9UL42 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PNMA2Q9UL42 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PNMA2Q9UL42 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PNMA2Q9UL42 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PNMA2Q9UL42 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PNMA2Q9UL42 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PNMA2Q9UL42 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PNMA2Q9UL42 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
PNMA2Q9UL42 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PNMA2Q9UL42 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PNMA2Q9UL42 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PNMA2Q9UL42 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PNMA2Q9UL42 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PNMA2Q9UL42 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PNMA2Q9UL42 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PNMA2Q9UL42 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PNMA2Q9UL42 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PNMA2Q9UL42 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PNMA2Q9UL42 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PNMA2Q9UL42 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PNMA2Q9UL42 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PNMA2Q9UL42 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PNMA2Q9UL42 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PNMA2Q9UL42 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PNMA2Q9UL42 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PNMA2Q9UL42 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PNMA2Q9UL42 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PNMA2Q9UL42 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PNMA2Q9UL42 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PNMA2Q9UL42 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PNMA2Q9UL42 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PNMA2Q9UL42 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PNMA2Q9UL42 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PNMA2Q9UL42 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PNMA2Q9UL42 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PNMA2Q9UL42 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PNMA2Q9UL42 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PNMA2Q9UL42 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PNMA2Q9UL42 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PNMA2Q9UL42 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PNMA2Q9UL42 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PNMA2Q9UL42 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PNMA2Q9UL42 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PNMA2Q9UL42 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PNMA2Q9UL42 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PNMA2Q9UL42 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PNMA2Q9UL42 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PNMA2Q9UL42 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PNMA2Q9UL42 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PNMA2Q9UL42 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PNMA2Q9UL42 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PNMA2Q9UL42 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PNMA2Q9UL42 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PNMA2Q9UL42 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PNMA2Q9UL42 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PNMA2Q9UL42 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PNMA2Q9UL42 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PNMA2Q9UL42 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PNMA2Q9UL42 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PNMA2Q9UL42 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PNMA2Q9UL42 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PNMA2Q9UL42 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PNMA2Q9UL42 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PNMA2Q9UL42 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PNMA2Q9UL42 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PNMA2Q9UL42 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PNMA2Q9UL42 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PNMA2Q9UL42 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PNMA2Q9UL42 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PNMA2Q9UL42 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PNMA2Q9UL42 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PNMA2Q9UL42 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PNMA2Q9UL42 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PNMA2Q9UL42 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PNMA2Q9UL42 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PNMA2Q9UL42 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PNMA2Q9UL42 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PNMA2Q9UL42 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PNMA2Q9UL42 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PNMA2Q9UL42 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PNMA2Q9UL42 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PNMA2Q9UL42 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PNMA2Q9UL42 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PNMA2Q9UL42 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PNMA2Q9UL42 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PNMA2Q9UL42 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PNMA2Q9UL42 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PNMA2Q9UL42 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PNMA2Q9UL42 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PNMA2Q9UL42 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms