Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PNMA3Q9UL41 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PNMA3Q9UL41 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PNMA3Q9UL41 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PNMA3Q9UL41 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
PNMA3Q9UL41 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PNMA3Q9UL41 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PNMA3Q9UL41 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PNMA3Q9UL41 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PNMA3Q9UL41 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PNMA3Q9UL41 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PNMA3Q9UL41 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PNMA3Q9UL41 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PNMA3Q9UL41 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PNMA3Q9UL41 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PNMA3Q9UL41 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PNMA3Q9UL41 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PNMA3Q9UL41 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PNMA3Q9UL41 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PNMA3Q9UL41 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PNMA3Q9UL41 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PNMA3Q9UL41 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PNMA3Q9UL41 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PNMA3Q9UL41 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PNMA3Q9UL41 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PNMA3Q9UL41 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PNMA3Q9UL41 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PNMA3Q9UL41 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PNMA3Q9UL41 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PNMA3Q9UL41 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PNMA3Q9UL41 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PNMA3Q9UL41 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PNMA3Q9UL41 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PNMA3Q9UL41 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PNMA3Q9UL41 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PNMA3Q9UL41 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PNMA3Q9UL41 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PNMA3Q9UL41 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PNMA3Q9UL41 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PNMA3Q9UL41 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PNMA3Q9UL41 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PNMA3Q9UL41 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PNMA3Q9UL41 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PNMA3Q9UL41 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PNMA3Q9UL41 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PNMA3Q9UL41 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PNMA3Q9UL41 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PNMA3Q9UL41 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PNMA3Q9UL41 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PNMA3Q9UL41 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PNMA3Q9UL41 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PNMA3Q9UL41 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PNMA3Q9UL41 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PNMA3Q9UL41 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PNMA3Q9UL41 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PNMA3Q9UL41 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PNMA3Q9UL41 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PNMA3Q9UL41 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PNMA3Q9UL41 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PNMA3Q9UL41 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PNMA3Q9UL41 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PNMA3Q9UL41 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PNMA3Q9UL41 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PNMA3Q9UL41 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PNMA3Q9UL41 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PNMA3Q9UL41 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PNMA3Q9UL41 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PNMA3Q9UL41 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PNMA3Q9UL41 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PNMA3Q9UL41 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PNMA3Q9UL41 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PNMA3Q9UL41 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PNMA3Q9UL41 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PNMA3Q9UL41 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PNMA3Q9UL41 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PNMA3Q9UL41 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PNMA3Q9UL41 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PNMA3Q9UL41 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PNMA3Q9UL41 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PNMA3Q9UL41 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PNMA3Q9UL41 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PNMA3Q9UL41 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PNMA3Q9UL41 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PNMA3Q9UL41 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PNMA3Q9UL41 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PNMA3Q9UL41 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PNMA3Q9UL41 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PNMA3Q9UL41 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PNMA3Q9UL41 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PNMA3Q9UL41 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PNMA3Q9UL41 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PNMA3Q9UL41 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PNMA3Q9UL41 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PNMA3Q9UL41 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PNMA3Q9UL41 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PNMA3Q9UL41 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PNMA3Q9UL41 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PNMA3Q9UL41 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PNMA3Q9UL41 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PNMA3Q9UL41 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms