Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
DSEQ9UL01 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DSEQ9UL01 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
DSEQ9UL01 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DSEQ9UL01 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DSEQ9UL01 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DSEQ9UL01 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DSEQ9UL01 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DSEQ9UL01 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DSEQ9UL01 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DSEQ9UL01 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DSEQ9UL01 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DSEQ9UL01 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DSEQ9UL01 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DSEQ9UL01 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DSEQ9UL01 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DSEQ9UL01 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DSEQ9UL01 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DSEQ9UL01 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DSEQ9UL01 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
DSEQ9UL01 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DSEQ9UL01 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DSEQ9UL01 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
DSEQ9UL01 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
DSEQ9UL01 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
DSEQ9UL01 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DSEQ9UL01 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DSEQ9UL01 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DSEQ9UL01 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DSEQ9UL01 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DSEQ9UL01 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
DSEQ9UL01 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DSEQ9UL01 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DSEQ9UL01 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DSEQ9UL01 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DSEQ9UL01 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DSEQ9UL01 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
DSEQ9UL01 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DSEQ9UL01 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DSEQ9UL01 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DSEQ9UL01 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DSEQ9UL01 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DSEQ9UL01 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DSEQ9UL01 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DSEQ9UL01 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DSEQ9UL01 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DSEQ9UL01 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DSEQ9UL01 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DSEQ9UL01 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DSEQ9UL01 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DSEQ9UL01 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DSEQ9UL01 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DSEQ9UL01 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DSEQ9UL01 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DSEQ9UL01 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DSEQ9UL01 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DSEQ9UL01 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DSEQ9UL01 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DSEQ9UL01 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DSEQ9UL01 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DSEQ9UL01 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DSEQ9UL01 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DSEQ9UL01 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DSEQ9UL01 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DSEQ9UL01 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DSEQ9UL01 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DSEQ9UL01 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DSEQ9UL01 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DSEQ9UL01 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DSEQ9UL01 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DSEQ9UL01 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DSEQ9UL01 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DSEQ9UL01 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DSEQ9UL01 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
DSEQ9UL01 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DSEQ9UL01 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DSEQ9UL01 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DSEQ9UL01 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DSEQ9UL01 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DSEQ9UL01 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DSEQ9UL01 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DSEQ9UL01 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DSEQ9UL01 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
DSEQ9UL01 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DSEQ9UL01 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DSEQ9UL01 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DSEQ9UL01 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DSEQ9UL01 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DSEQ9UL01 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DSEQ9UL01 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
DSEQ9UL01 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DSEQ9UL01 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DSEQ9UL01 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DSEQ9UL01 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DSEQ9UL01 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DSEQ9UL01 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DSEQ9UL01 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DSEQ9UL01 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DSEQ9UL01 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
DSEQ9UL01 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms