Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX7

NUP50, Nuclear pore complex protein Nup50, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50Q9UKX7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP50Q9UKX7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NUP50Q9UKX7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP50Q9UKX7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP50Q9UKX7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP50Q9UKX7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NUP50Q9UKX7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP50Q9UKX7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP50Q9UKX7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP50Q9UKX7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP50Q9UKX7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NUP50Q9UKX7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP50Q9UKX7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP50Q9UKX7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP50Q9UKX7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP50Q9UKX7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP50Q9UKX7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP50Q9UKX7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NUP50Q9UKX7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP50Q9UKX7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP50Q9UKX7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP50Q9UKX7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP50Q9UKX7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP50Q9UKX7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP50Q9UKX7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUP50Q9UKX7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUP50Q9UKX7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP50Q9UKX7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP50Q9UKX7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP50Q9UKX7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP50Q9UKX7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUP50Q9UKX7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP50Q9UKX7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP50Q9UKX7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP50Q9UKX7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP50Q9UKX7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP50Q9UKX7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUP50Q9UKX7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP50Q9UKX7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP50Q9UKX7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP50Q9UKX7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP50Q9UKX7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP50Q9UKX7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP50Q9UKX7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP50Q9UKX7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUP50Q9UKX7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP50Q9UKX7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP50Q9UKX7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP50Q9UKX7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUP50Q9UKX7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP50Q9UKX7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP50Q9UKX7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP50Q9UKX7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP50Q9UKX7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP50Q9UKX7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP50Q9UKX7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP50Q9UKX7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUP50Q9UKX7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP50Q9UKX7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP50Q9UKX7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP50Q9UKX7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP50Q9UKX7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP50Q9UKX7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP50Q9UKX7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUP50Q9UKX7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP50Q9UKX7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP50Q9UKX7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP50Q9UKX7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP50Q9UKX7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP50Q9UKX7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUP50Q9UKX7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP50Q9UKX7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP50Q9UKX7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP50Q9UKX7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP50Q9UKX7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP50Q9UKX7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP50Q9UKX7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP50Q9UKX7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP50Q9UKX7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUP50Q9UKX7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP50Q9UKX7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP50Q9UKX7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP50Q9UKX7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP50Q9UKX7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP50Q9UKX7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUP50Q9UKX7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP50Q9UKX7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP50Q9UKX7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP50Q9UKX7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP50Q9UKX7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP50Q9UKX7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP50Q9UKX7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP50Q9UKX7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP50Q9UKX7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP50Q9UKX7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP50Q9UKX7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP50Q9UKX7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP50Q9UKX7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP50Q9UKX7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP50Q9UKX7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms