Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ1

LAMP5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP5Q9UJQ1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMP5Q9UJQ1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMP5Q9UJQ1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LAMP5Q9UJQ1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LAMP5Q9UJQ1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LAMP5Q9UJQ1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMP5Q9UJQ1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAMP5Q9UJQ1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMP5Q9UJQ1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMP5Q9UJQ1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMP5Q9UJQ1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAMP5Q9UJQ1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMP5Q9UJQ1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMP5Q9UJQ1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMP5Q9UJQ1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAMP5Q9UJQ1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMP5Q9UJQ1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMP5Q9UJQ1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMP5Q9UJQ1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMP5Q9UJQ1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMP5Q9UJQ1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMP5Q9UJQ1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMP5Q9UJQ1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAMP5Q9UJQ1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMP5Q9UJQ1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMP5Q9UJQ1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAMP5Q9UJQ1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMP5Q9UJQ1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMP5Q9UJQ1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMP5Q9UJQ1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMP5Q9UJQ1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMP5Q9UJQ1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMP5Q9UJQ1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAMP5Q9UJQ1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMP5Q9UJQ1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMP5Q9UJQ1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMP5Q9UJQ1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMP5Q9UJQ1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LAMP5Q9UJQ1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMP5Q9UJQ1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMP5Q9UJQ1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMP5Q9UJQ1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMP5Q9UJQ1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LAMP5Q9UJQ1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMP5Q9UJQ1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMP5Q9UJQ1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMP5Q9UJQ1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMP5Q9UJQ1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMP5Q9UJQ1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMP5Q9UJQ1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMP5Q9UJQ1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMP5Q9UJQ1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LAMP5Q9UJQ1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMP5Q9UJQ1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMP5Q9UJQ1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMP5Q9UJQ1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMP5Q9UJQ1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMP5Q9UJQ1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMP5Q9UJQ1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMP5Q9UJQ1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMP5Q9UJQ1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMP5Q9UJQ1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMP5Q9UJQ1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMP5Q9UJQ1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMP5Q9UJQ1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMP5Q9UJQ1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMP5Q9UJQ1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMP5Q9UJQ1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LAMP5Q9UJQ1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMP5Q9UJQ1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMP5Q9UJQ1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMP5Q9UJQ1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMP5Q9UJQ1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMP5Q9UJQ1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMP5Q9UJQ1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMP5Q9UJQ1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMP5Q9UJQ1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMP5Q9UJQ1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMP5Q9UJQ1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMP5Q9UJQ1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMP5Q9UJQ1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMP5Q9UJQ1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMP5Q9UJQ1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMP5Q9UJQ1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMP5Q9UJQ1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMP5Q9UJQ1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMP5Q9UJQ1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMP5Q9UJQ1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMP5Q9UJQ1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMP5Q9UJQ1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMP5Q9UJQ1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMP5Q9UJQ1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMP5Q9UJQ1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMP5Q9UJQ1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMP5Q9UJQ1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMP5Q9UJQ1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMP5Q9UJQ1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMP5Q9UJQ1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMP5Q9UJQ1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMP5Q9UJQ1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms