Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJA2

CRLS1, Cardiolipin synthase (CMP-forming), humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRLS1Q9UJA2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRLS1Q9UJA2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRLS1Q9UJA2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRLS1Q9UJA2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRLS1Q9UJA2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRLS1Q9UJA2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRLS1Q9UJA2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CRLS1Q9UJA2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CRLS1Q9UJA2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRLS1Q9UJA2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRLS1Q9UJA2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRLS1Q9UJA2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRLS1Q9UJA2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRLS1Q9UJA2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRLS1Q9UJA2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRLS1Q9UJA2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRLS1Q9UJA2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRLS1Q9UJA2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRLS1Q9UJA2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CRLS1Q9UJA2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CRLS1Q9UJA2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRLS1Q9UJA2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRLS1Q9UJA2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRLS1Q9UJA2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRLS1Q9UJA2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRLS1Q9UJA2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRLS1Q9UJA2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRLS1Q9UJA2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CRLS1Q9UJA2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CRLS1Q9UJA2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRLS1Q9UJA2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CRLS1Q9UJA2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRLS1Q9UJA2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRLS1Q9UJA2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRLS1Q9UJA2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRLS1Q9UJA2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRLS1Q9UJA2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRLS1Q9UJA2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRLS1Q9UJA2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRLS1Q9UJA2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRLS1Q9UJA2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRLS1Q9UJA2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRLS1Q9UJA2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRLS1Q9UJA2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRLS1Q9UJA2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRLS1Q9UJA2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRLS1Q9UJA2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRLS1Q9UJA2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRLS1Q9UJA2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRLS1Q9UJA2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRLS1Q9UJA2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRLS1Q9UJA2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRLS1Q9UJA2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRLS1Q9UJA2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRLS1Q9UJA2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRLS1Q9UJA2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRLS1Q9UJA2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRLS1Q9UJA2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRLS1Q9UJA2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRLS1Q9UJA2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CRLS1Q9UJA2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRLS1Q9UJA2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRLS1Q9UJA2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRLS1Q9UJA2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRLS1Q9UJA2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRLS1Q9UJA2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRLS1Q9UJA2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRLS1Q9UJA2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRLS1Q9UJA2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRLS1Q9UJA2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRLS1Q9UJA2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CRLS1Q9UJA2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRLS1Q9UJA2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRLS1Q9UJA2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRLS1Q9UJA2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRLS1Q9UJA2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRLS1Q9UJA2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRLS1Q9UJA2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRLS1Q9UJA2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRLS1Q9UJA2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRLS1Q9UJA2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRLS1Q9UJA2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRLS1Q9UJA2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRLS1Q9UJA2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRLS1Q9UJA2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRLS1Q9UJA2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRLS1Q9UJA2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CRLS1Q9UJA2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRLS1Q9UJA2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRLS1Q9UJA2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRLS1Q9UJA2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRLS1Q9UJA2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRLS1Q9UJA2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CRLS1Q9UJA2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRLS1Q9UJA2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRLS1Q9UJA2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRLS1Q9UJA2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRLS1Q9UJA2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CRLS1Q9UJA2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRLS1Q9UJA2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms