Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CPA4Q9UI42 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CPA4Q9UI42 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CPA4Q9UI42 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CPA4Q9UI42 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CPA4Q9UI42 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CPA4Q9UI42 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CPA4Q9UI42 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CPA4Q9UI42 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CPA4Q9UI42 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CPA4Q9UI42 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CPA4Q9UI42 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CPA4Q9UI42 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CPA4Q9UI42 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CPA4Q9UI42 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CPA4Q9UI42 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CPA4Q9UI42 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CPA4Q9UI42 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CPA4Q9UI42 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CPA4Q9UI42 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CPA4Q9UI42 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CPA4Q9UI42 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CPA4Q9UI42 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CPA4Q9UI42 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CPA4Q9UI42 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CPA4Q9UI42 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CPA4Q9UI42 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CPA4Q9UI42 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CPA4Q9UI42 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CPA4Q9UI42 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CPA4Q9UI42 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CPA4Q9UI42 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CPA4Q9UI42 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CPA4Q9UI42 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CPA4Q9UI42 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CPA4Q9UI42 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CPA4Q9UI42 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CPA4Q9UI42 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CPA4Q9UI42 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CPA4Q9UI42 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CPA4Q9UI42 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CPA4Q9UI42 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CPA4Q9UI42 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CPA4Q9UI42 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CPA4Q9UI42 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CPA4Q9UI42 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CPA4Q9UI42 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CPA4Q9UI42 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CPA4Q9UI42 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CPA4Q9UI42 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CPA4Q9UI42 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CPA4Q9UI42 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CPA4Q9UI42 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CPA4Q9UI42 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CPA4Q9UI42 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CPA4Q9UI42 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CPA4Q9UI42 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CPA4Q9UI42 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CPA4Q9UI42 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CPA4Q9UI42 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CPA4Q9UI42 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CPA4Q9UI42 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CPA4Q9UI42 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CPA4Q9UI42 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CPA4Q9UI42 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CPA4Q9UI42 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CPA4Q9UI42 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CPA4Q9UI42 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CPA4Q9UI42 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CPA4Q9UI42 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CPA4Q9UI42 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CPA4Q9UI42 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CPA4Q9UI42 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CPA4Q9UI42 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CPA4Q9UI42 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CPA4Q9UI42 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CPA4Q9UI42 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CPA4Q9UI42 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CPA4Q9UI42 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CPA4Q9UI42 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CPA4Q9UI42 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CPA4Q9UI42 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CPA4Q9UI42 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CPA4Q9UI42 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CPA4Q9UI42 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CPA4Q9UI42 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CPA4Q9UI42 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CPA4Q9UI42 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CPA4Q9UI42 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CPA4Q9UI42 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CPA4Q9UI42 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CPA4Q9UI42 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CPA4Q9UI42 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CPA4Q9UI42 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CPA4Q9UI42 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CPA4Q9UI42 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CPA4Q9UI42 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CPA4Q9UI42 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CPA4Q9UI42 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CPA4Q9UI42 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms