Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SRP68Q9UHB9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
SRP68Q9UHB9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SRP68Q9UHB9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
SRP68Q9UHB9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SRP68Q9UHB9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SRP68Q9UHB9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SRP68Q9UHB9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SRP68Q9UHB9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SRP68Q9UHB9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SRP68Q9UHB9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SRP68Q9UHB9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SRP68Q9UHB9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SRP68Q9UHB9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SRP68Q9UHB9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SRP68Q9UHB9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SRP68Q9UHB9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SRP68Q9UHB9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SRP68Q9UHB9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SRP68Q9UHB9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SRP68Q9UHB9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SRP68Q9UHB9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SRP68Q9UHB9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SRP68Q9UHB9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
SRP68Q9UHB9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SRP68Q9UHB9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SRP68Q9UHB9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SRP68Q9UHB9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SRP68Q9UHB9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SRP68Q9UHB9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SRP68Q9UHB9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SRP68Q9UHB9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SRP68Q9UHB9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SRP68Q9UHB9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SRP68Q9UHB9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SRP68Q9UHB9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SRP68Q9UHB9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SRP68Q9UHB9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SRP68Q9UHB9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SRP68Q9UHB9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SRP68Q9UHB9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SRP68Q9UHB9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SRP68Q9UHB9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SRP68Q9UHB9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SRP68Q9UHB9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SRP68Q9UHB9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
SRP68Q9UHB9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SRP68Q9UHB9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
SRP68Q9UHB9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SRP68Q9UHB9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SRP68Q9UHB9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SRP68Q9UHB9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SRP68Q9UHB9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SRP68Q9UHB9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SRP68Q9UHB9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SRP68Q9UHB9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SRP68Q9UHB9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SRP68Q9UHB9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
SRP68Q9UHB9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SRP68Q9UHB9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SRP68Q9UHB9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SRP68Q9UHB9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SRP68Q9UHB9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
SRP68Q9UHB9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SRP68Q9UHB9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SRP68Q9UHB9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SRP68Q9UHB9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SRP68Q9UHB9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SRP68Q9UHB9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SRP68Q9UHB9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SRP68Q9UHB9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SRP68Q9UHB9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
SRP68Q9UHB9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
SRP68Q9UHB9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC32■■■□□ 2.71
SRP68Q9UHB9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC32■■■□□ 2.71
SRP68Q9UHB9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SRP68Q9UHB9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SRP68Q9UHB9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SRP68Q9UHB9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SRP68Q9UHB9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SRP68Q9UHB9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SRP68Q9UHB9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SRP68Q9UHB9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SRP68Q9UHB9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SRP68Q9UHB9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SRP68Q9UHB9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SRP68Q9UHB9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
SRP68Q9UHB9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
SRP68Q9UHB9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SRP68Q9UHB9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SRP68Q9UHB9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SRP68Q9UHB9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SRP68Q9UHB9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SRP68Q9UHB9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SRP68Q9UHB9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SRP68Q9UHB9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SRP68Q9UHB9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SRP68Q9UHB9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SRP68Q9UHB9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SRP68Q9UHB9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms