Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
POLKQ9UBT6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
POLKQ9UBT6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
POLKQ9UBT6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
POLKQ9UBT6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
POLKQ9UBT6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
POLKQ9UBT6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
POLKQ9UBT6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
POLKQ9UBT6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
POLKQ9UBT6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
POLKQ9UBT6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
POLKQ9UBT6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
POLKQ9UBT6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
POLKQ9UBT6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
POLKQ9UBT6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
POLKQ9UBT6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
POLKQ9UBT6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
POLKQ9UBT6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
POLKQ9UBT6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
POLKQ9UBT6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
POLKQ9UBT6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
POLKQ9UBT6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
POLKQ9UBT6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
POLKQ9UBT6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
POLKQ9UBT6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
POLKQ9UBT6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
POLKQ9UBT6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
POLKQ9UBT6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
POLKQ9UBT6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
POLKQ9UBT6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
POLKQ9UBT6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
POLKQ9UBT6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
POLKQ9UBT6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
POLKQ9UBT6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
POLKQ9UBT6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
POLKQ9UBT6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
POLKQ9UBT6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
POLKQ9UBT6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
POLKQ9UBT6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.02
POLKQ9UBT6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
POLKQ9UBT6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
POLKQ9UBT6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
POLKQ9UBT6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
POLKQ9UBT6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
POLKQ9UBT6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
POLKQ9UBT6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
POLKQ9UBT6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
POLKQ9UBT6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
POLKQ9UBT6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
POLKQ9UBT6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
POLKQ9UBT6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
POLKQ9UBT6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
POLKQ9UBT6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
POLKQ9UBT6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
POLKQ9UBT6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
POLKQ9UBT6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
POLKQ9UBT6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
POLKQ9UBT6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
POLKQ9UBT6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
POLKQ9UBT6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
POLKQ9UBT6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
POLKQ9UBT6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
POLKQ9UBT6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
POLKQ9UBT6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
POLKQ9UBT6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
POLKQ9UBT6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
POLKQ9UBT6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
POLKQ9UBT6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
POLKQ9UBT6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
POLKQ9UBT6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
POLKQ9UBT6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
POLKQ9UBT6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
POLKQ9UBT6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
POLKQ9UBT6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
POLKQ9UBT6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
POLKQ9UBT6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
POLKQ9UBT6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
POLKQ9UBT6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
POLKQ9UBT6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
POLKQ9UBT6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC33.81■■■■□ 3
POLKQ9UBT6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC33.81■■■■□ 3
POLKQ9UBT6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
POLKQ9UBT6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
POLKQ9UBT6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
POLKQ9UBT6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
POLKQ9UBT6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
POLKQ9UBT6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
POLKQ9UBT6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
POLKQ9UBT6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
POLKQ9UBT6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
POLKQ9UBT6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
POLKQ9UBT6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
POLKQ9UBT6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
POLKQ9UBT6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
POLKQ9UBT6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
POLKQ9UBT6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
POLKQ9UBT6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
POLKQ9UBT6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.78■■■■□ 3
POLKQ9UBT6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
POLKQ9UBT6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms