Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD5

ORC3, Origin recognition complex subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ORC3Q9UBD5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ORC3Q9UBD5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ORC3Q9UBD5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ORC3Q9UBD5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ORC3Q9UBD5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ORC3Q9UBD5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ORC3Q9UBD5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ORC3Q9UBD5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ORC3Q9UBD5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ORC3Q9UBD5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ORC3Q9UBD5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ORC3Q9UBD5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ORC3Q9UBD5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ORC3Q9UBD5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ORC3Q9UBD5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ORC3Q9UBD5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ORC3Q9UBD5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ORC3Q9UBD5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ORC3Q9UBD5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ORC3Q9UBD5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ORC3Q9UBD5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ORC3Q9UBD5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ORC3Q9UBD5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ORC3Q9UBD5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ORC3Q9UBD5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ORC3Q9UBD5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ORC3Q9UBD5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ORC3Q9UBD5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ORC3Q9UBD5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ORC3Q9UBD5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ORC3Q9UBD5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ORC3Q9UBD5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ORC3Q9UBD5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ORC3Q9UBD5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ORC3Q9UBD5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ORC3Q9UBD5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ORC3Q9UBD5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ORC3Q9UBD5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ORC3Q9UBD5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ORC3Q9UBD5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ORC3Q9UBD5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ORC3Q9UBD5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ORC3Q9UBD5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ORC3Q9UBD5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ORC3Q9UBD5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ORC3Q9UBD5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ORC3Q9UBD5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ORC3Q9UBD5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ORC3Q9UBD5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ORC3Q9UBD5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ORC3Q9UBD5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ORC3Q9UBD5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ORC3Q9UBD5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ORC3Q9UBD5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ORC3Q9UBD5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ORC3Q9UBD5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ORC3Q9UBD5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ORC3Q9UBD5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ORC3Q9UBD5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ORC3Q9UBD5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ORC3Q9UBD5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ORC3Q9UBD5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ORC3Q9UBD5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ORC3Q9UBD5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ORC3Q9UBD5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ORC3Q9UBD5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ORC3Q9UBD5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ORC3Q9UBD5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ORC3Q9UBD5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ORC3Q9UBD5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ORC3Q9UBD5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ORC3Q9UBD5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ORC3Q9UBD5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ORC3Q9UBD5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ORC3Q9UBD5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ORC3Q9UBD5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ORC3Q9UBD5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ORC3Q9UBD5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ORC3Q9UBD5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ORC3Q9UBD5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ORC3Q9UBD5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ORC3Q9UBD5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ORC3Q9UBD5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ORC3Q9UBD5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ORC3Q9UBD5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ORC3Q9UBD5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ORC3Q9UBD5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ORC3Q9UBD5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ORC3Q9UBD5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ORC3Q9UBD5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ORC3Q9UBD5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ORC3Q9UBD5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ORC3Q9UBD5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ORC3Q9UBD5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ORC3Q9UBD5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ORC3Q9UBD5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ORC3Q9UBD5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ORC3Q9UBD5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ORC3Q9UBD5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ORC3Q9UBD5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms