Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC17A6Q9P2U8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC17A6Q9P2U8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC17A6Q9P2U8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC17A6Q9P2U8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC17A6Q9P2U8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC17A6Q9P2U8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC17A6Q9P2U8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC17A6Q9P2U8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC17A6Q9P2U8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC17A6Q9P2U8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC17A6Q9P2U8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC17A6Q9P2U8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC17A6Q9P2U8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC17A6Q9P2U8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC17A6Q9P2U8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC17A6Q9P2U8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC17A6Q9P2U8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC17A6Q9P2U8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC17A6Q9P2U8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC17A6Q9P2U8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC17A6Q9P2U8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC17A6Q9P2U8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC17A6Q9P2U8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC17A6Q9P2U8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC17A6Q9P2U8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC17A6Q9P2U8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC17A6Q9P2U8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC17A6Q9P2U8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC17A6Q9P2U8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC17A6Q9P2U8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC17A6Q9P2U8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC17A6Q9P2U8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC17A6Q9P2U8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC17A6Q9P2U8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC17A6Q9P2U8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC17A6Q9P2U8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC17A6Q9P2U8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC17A6Q9P2U8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC17A6Q9P2U8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC17A6Q9P2U8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC17A6Q9P2U8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC17A6Q9P2U8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC17A6Q9P2U8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC17A6Q9P2U8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC17A6Q9P2U8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC17A6Q9P2U8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC17A6Q9P2U8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC17A6Q9P2U8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC17A6Q9P2U8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC17A6Q9P2U8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC17A6Q9P2U8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC17A6Q9P2U8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC17A6Q9P2U8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC17A6Q9P2U8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC17A6Q9P2U8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC17A6Q9P2U8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC17A6Q9P2U8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC17A6Q9P2U8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC17A6Q9P2U8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC17A6Q9P2U8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC17A6Q9P2U8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC17A6Q9P2U8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC17A6Q9P2U8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC17A6Q9P2U8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC17A6Q9P2U8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC17A6Q9P2U8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC17A6Q9P2U8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC17A6Q9P2U8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC17A6Q9P2U8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC17A6Q9P2U8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC17A6Q9P2U8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC17A6Q9P2U8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC17A6Q9P2U8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC17A6Q9P2U8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC17A6Q9P2U8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC17A6Q9P2U8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC17A6Q9P2U8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC17A6Q9P2U8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC17A6Q9P2U8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC17A6Q9P2U8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC17A6Q9P2U8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC17A6Q9P2U8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC17A6Q9P2U8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC17A6Q9P2U8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC17A6Q9P2U8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC17A6Q9P2U8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC17A6Q9P2U8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC17A6Q9P2U8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC17A6Q9P2U8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC17A6Q9P2U8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC17A6Q9P2U8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC17A6Q9P2U8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC17A6Q9P2U8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC17A6Q9P2U8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC17A6Q9P2U8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC17A6Q9P2U8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC17A6Q9P2U8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC17A6Q9P2U8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC17A6Q9P2U8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms