Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
LRP2BPQ9P2M1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
LRP2BPQ9P2M1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
LRP2BPQ9P2M1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
LRP2BPQ9P2M1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
LRP2BPQ9P2M1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
LRP2BPQ9P2M1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
LRP2BPQ9P2M1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
LRP2BPQ9P2M1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
LRP2BPQ9P2M1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
LRP2BPQ9P2M1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
LRP2BPQ9P2M1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
LRP2BPQ9P2M1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
LRP2BPQ9P2M1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
LRP2BPQ9P2M1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
LRP2BPQ9P2M1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
LRP2BPQ9P2M1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
LRP2BPQ9P2M1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
LRP2BPQ9P2M1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
LRP2BPQ9P2M1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
LRP2BPQ9P2M1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
LRP2BPQ9P2M1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
LRP2BPQ9P2M1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
LRP2BPQ9P2M1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
LRP2BPQ9P2M1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
LRP2BPQ9P2M1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
LRP2BPQ9P2M1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
LRP2BPQ9P2M1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
LRP2BPQ9P2M1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
LRP2BPQ9P2M1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LRP2BPQ9P2M1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LRP2BPQ9P2M1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LRP2BPQ9P2M1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
LRP2BPQ9P2M1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
LRP2BPQ9P2M1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
LRP2BPQ9P2M1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
LRP2BPQ9P2M1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
LRP2BPQ9P2M1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
LRP2BPQ9P2M1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LRP2BPQ9P2M1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
LRP2BPQ9P2M1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
LRP2BPQ9P2M1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
LRP2BPQ9P2M1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
LRP2BPQ9P2M1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
LRP2BPQ9P2M1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
LRP2BPQ9P2M1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
LRP2BPQ9P2M1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
LRP2BPQ9P2M1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
LRP2BPQ9P2M1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
LRP2BPQ9P2M1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
LRP2BPQ9P2M1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
LRP2BPQ9P2M1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
LRP2BPQ9P2M1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
LRP2BPQ9P2M1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LRP2BPQ9P2M1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
LRP2BPQ9P2M1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
LRP2BPQ9P2M1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
LRP2BPQ9P2M1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
LRP2BPQ9P2M1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
LRP2BPQ9P2M1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
LRP2BPQ9P2M1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LRP2BPQ9P2M1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
LRP2BPQ9P2M1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LRP2BPQ9P2M1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
LRP2BPQ9P2M1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
LRP2BPQ9P2M1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
LRP2BPQ9P2M1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
LRP2BPQ9P2M1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
LRP2BPQ9P2M1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
LRP2BPQ9P2M1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
LRP2BPQ9P2M1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
LRP2BPQ9P2M1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
LRP2BPQ9P2M1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
LRP2BPQ9P2M1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
LRP2BPQ9P2M1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
LRP2BPQ9P2M1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
LRP2BPQ9P2M1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
LRP2BPQ9P2M1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
LRP2BPQ9P2M1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
LRP2BPQ9P2M1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
LRP2BPQ9P2M1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
LRP2BPQ9P2M1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
LRP2BPQ9P2M1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
LRP2BPQ9P2M1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LRP2BPQ9P2M1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
LRP2BPQ9P2M1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
LRP2BPQ9P2M1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
LRP2BPQ9P2M1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LRP2BPQ9P2M1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
LRP2BPQ9P2M1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LRP2BPQ9P2M1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LRP2BPQ9P2M1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LRP2BPQ9P2M1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LRP2BPQ9P2M1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LRP2BPQ9P2M1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
LRP2BPQ9P2M1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
LRP2BPQ9P2M1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
LRP2BPQ9P2M1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LRP2BPQ9P2M1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LRP2BPQ9P2M1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms