Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTTNBP2NLQ9P2B4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTTNBP2NLQ9P2B4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTTNBP2NLQ9P2B4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTTNBP2NLQ9P2B4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTTNBP2NLQ9P2B4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTTNBP2NLQ9P2B4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTTNBP2NLQ9P2B4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTTNBP2NLQ9P2B4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTTNBP2NLQ9P2B4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTTNBP2NLQ9P2B4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTTNBP2NLQ9P2B4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTTNBP2NLQ9P2B4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTTNBP2NLQ9P2B4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTTNBP2NLQ9P2B4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CTTNBP2NLQ9P2B4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CTTNBP2NLQ9P2B4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CTTNBP2NLQ9P2B4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTTNBP2NLQ9P2B4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTTNBP2NLQ9P2B4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTTNBP2NLQ9P2B4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTTNBP2NLQ9P2B4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTTNBP2NLQ9P2B4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTTNBP2NLQ9P2B4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTTNBP2NLQ9P2B4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTTNBP2NLQ9P2B4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CTTNBP2NLQ9P2B4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTTNBP2NLQ9P2B4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTTNBP2NLQ9P2B4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTTNBP2NLQ9P2B4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTTNBP2NLQ9P2B4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTTNBP2NLQ9P2B4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTTNBP2NLQ9P2B4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTTNBP2NLQ9P2B4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTTNBP2NLQ9P2B4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTTNBP2NLQ9P2B4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTTNBP2NLQ9P2B4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTTNBP2NLQ9P2B4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTTNBP2NLQ9P2B4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTTNBP2NLQ9P2B4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CTTNBP2NLQ9P2B4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTTNBP2NLQ9P2B4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTTNBP2NLQ9P2B4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTTNBP2NLQ9P2B4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTTNBP2NLQ9P2B4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTTNBP2NLQ9P2B4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTTNBP2NLQ9P2B4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTTNBP2NLQ9P2B4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTTNBP2NLQ9P2B4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTTNBP2NLQ9P2B4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTTNBP2NLQ9P2B4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTTNBP2NLQ9P2B4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTTNBP2NLQ9P2B4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTTNBP2NLQ9P2B4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTTNBP2NLQ9P2B4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTTNBP2NLQ9P2B4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTTNBP2NLQ9P2B4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTTNBP2NLQ9P2B4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTTNBP2NLQ9P2B4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTTNBP2NLQ9P2B4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTTNBP2NLQ9P2B4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTTNBP2NLQ9P2B4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms