Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HIGD1BQ9P298 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIGD1BQ9P298 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIGD1BQ9P298 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HIGD1BQ9P298 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIGD1BQ9P298 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIGD1BQ9P298 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIGD1BQ9P298 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIGD1BQ9P298 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIGD1BQ9P298 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIGD1BQ9P298 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIGD1BQ9P298 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HIGD1BQ9P298 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIGD1BQ9P298 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIGD1BQ9P298 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIGD1BQ9P298 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIGD1BQ9P298 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIGD1BQ9P298 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIGD1BQ9P298 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIGD1BQ9P298 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIGD1BQ9P298 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIGD1BQ9P298 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HIGD1BQ9P298 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIGD1BQ9P298 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIGD1BQ9P298 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIGD1BQ9P298 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIGD1BQ9P298 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIGD1BQ9P298 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIGD1BQ9P298 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIGD1BQ9P298 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIGD1BQ9P298 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIGD1BQ9P298 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIGD1BQ9P298 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIGD1BQ9P298 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HIGD1BQ9P298 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIGD1BQ9P298 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIGD1BQ9P298 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIGD1BQ9P298 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIGD1BQ9P298 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIGD1BQ9P298 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HIGD1BQ9P298 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIGD1BQ9P298 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HIGD1BQ9P298 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIGD1BQ9P298 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIGD1BQ9P298 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HIGD1BQ9P298 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIGD1BQ9P298 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIGD1BQ9P298 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIGD1BQ9P298 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIGD1BQ9P298 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HIGD1BQ9P298 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HIGD1BQ9P298 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIGD1BQ9P298 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIGD1BQ9P298 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIGD1BQ9P298 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIGD1BQ9P298 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIGD1BQ9P298 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIGD1BQ9P298 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HIGD1BQ9P298 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIGD1BQ9P298 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIGD1BQ9P298 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIGD1BQ9P298 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIGD1BQ9P298 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIGD1BQ9P298 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIGD1BQ9P298 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIGD1BQ9P298 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIGD1BQ9P298 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIGD1BQ9P298 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIGD1BQ9P298 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIGD1BQ9P298 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIGD1BQ9P298 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIGD1BQ9P298 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIGD1BQ9P298 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIGD1BQ9P298 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIGD1BQ9P298 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIGD1BQ9P298 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD1BQ9P298 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD1BQ9P298 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD1BQ9P298 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD1BQ9P298 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD1BQ9P298 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD1BQ9P298 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD1BQ9P298 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD1BQ9P298 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD1BQ9P298 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIGD1BQ9P298 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HIGD1BQ9P298 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIGD1BQ9P298 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIGD1BQ9P298 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIGD1BQ9P298 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIGD1BQ9P298 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIGD1BQ9P298 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIGD1BQ9P298 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIGD1BQ9P298 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIGD1BQ9P298 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIGD1BQ9P298 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIGD1BQ9P298 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIGD1BQ9P298 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIGD1BQ9P298 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIGD1BQ9P298 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms