Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC52.97■■■■■ 6.07
CCDC180Q9P1Z9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.96■■■■■ 6.07
CCDC180Q9P1Z9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.96■■■■■ 6.07
CCDC180Q9P1Z9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.96■■■■■ 6.07
CCDC180Q9P1Z9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC52.96■■■■■ 6.07
CCDC180Q9P1Z9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.96■■■■■ 6.07
CCDC180Q9P1Z9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC52.95■■■■■ 6.07
CCDC180Q9P1Z9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC52.95■■■■■ 6.07
CCDC180Q9P1Z9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.95■■■■■ 6.07
CCDC180Q9P1Z9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC52.95■■■■■ 6.07
CCDC180Q9P1Z9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC52.94■■■■■ 6.07
CCDC180Q9P1Z9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC52.93■■■■■ 6.06
CCDC180Q9P1Z9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.93■■■■■ 6.06
CCDC180Q9P1Z9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC52.93■■■■■ 6.06
CCDC180Q9P1Z9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC52.93■■■■■ 6.06
CCDC180Q9P1Z9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC52.92■■■■■ 6.06
CCDC180Q9P1Z9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC52.91■■■■■ 6.06
CCDC180Q9P1Z9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC52.9■■■■■ 6.06
CCDC180Q9P1Z9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.9■■■■■ 6.06
CCDC180Q9P1Z9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.89■■■■■ 6.06
CCDC180Q9P1Z9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC52.89■■■■■ 6.06
CCDC180Q9P1Z9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.88■■■■■ 6.06
CCDC180Q9P1Z9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.87■■■■■ 6.05
CCDC180Q9P1Z9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC52.87■■■■■ 6.05
CCDC180Q9P1Z9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC52.86■■■■■ 6.05
CCDC180Q9P1Z9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC52.86■■■■■ 6.05
CCDC180Q9P1Z9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC52.85■■■■■ 6.05
CCDC180Q9P1Z9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC52.85■■■■■ 6.05
CCDC180Q9P1Z9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.84■■■■■ 6.05
CCDC180Q9P1Z9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.84■■■■■ 6.05
CCDC180Q9P1Z9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.83■■■■■ 6.05
CCDC180Q9P1Z9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC52.83■■■■■ 6.05
CCDC180Q9P1Z9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.83■■■■■ 6.05
CCDC180Q9P1Z9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.82■■■■■ 6.05
CCDC180Q9P1Z9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC52.82■■■■■ 6.05
CCDC180Q9P1Z9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.81■■■■■ 6.04
CCDC180Q9P1Z9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC52.8■■■■■ 6.04
CCDC180Q9P1Z9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC52.8■■■■■ 6.04
CCDC180Q9P1Z9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.79■■■■■ 6.04
CCDC180Q9P1Z9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.78■■■■■ 6.04
CCDC180Q9P1Z9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC52.78■■■■■ 6.04
CCDC180Q9P1Z9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.77■■■■■ 6.04
CCDC180Q9P1Z9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC52.77■■■■■ 6.04
CCDC180Q9P1Z9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.77■■■■■ 6.04
CCDC180Q9P1Z9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC52.77■■■■■ 6.04
CCDC180Q9P1Z9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC52.77■■■■■ 6.04
CCDC180Q9P1Z9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.76■■■■■ 6.04
CCDC180Q9P1Z9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC52.76■■■■■ 6.04
CCDC180Q9P1Z9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC52.75■■■■■ 6.03
CCDC180Q9P1Z9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC52.75■■■■■ 6.03
CCDC180Q9P1Z9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC52.75■■■■■ 6.03
CCDC180Q9P1Z9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.75■■■■■ 6.03
CCDC180Q9P1Z9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.75■■■■■ 6.03
CCDC180Q9P1Z9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC52.74■■■■■ 6.03
CCDC180Q9P1Z9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC52.74■■■■■ 6.03
CCDC180Q9P1Z9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC52.73■■■■■ 6.03
CCDC180Q9P1Z9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC52.73■■■■■ 6.03
CCDC180Q9P1Z9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC52.72■■■■■ 6.03
CCDC180Q9P1Z9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.72■■■■■ 6.03
CCDC180Q9P1Z9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.71■■■■■ 6.03
CCDC180Q9P1Z9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC52.71■■■■■ 6.03
CCDC180Q9P1Z9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.7■■■■■ 6.03
CCDC180Q9P1Z9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC52.7■■■■■ 6.03
CCDC180Q9P1Z9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC52.69■■■■■ 6.02
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC52.67■■■■■ 6.02
CCDC180Q9P1Z9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC52.67■■■■■ 6.02
CCDC180Q9P1Z9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.66■■■■■ 6.02
CCDC180Q9P1Z9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC52.66■■■■■ 6.02
CCDC180Q9P1Z9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC52.65■■■■■ 6.02
CCDC180Q9P1Z9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.64■■■■■ 6.02
CCDC180Q9P1Z9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.64■■■■■ 6.02
CCDC180Q9P1Z9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC52.63■■■■■ 6.02
CCDC180Q9P1Z9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC52.63■■■■■ 6.02
CCDC180Q9P1Z9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC52.63■■■■■ 6.02
CCDC180Q9P1Z9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.62■■■■■ 6.01
CCDC180Q9P1Z9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.62■■■■■ 6.01
CCDC180Q9P1Z9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC52.62■■■■■ 6.01
CCDC180Q9P1Z9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.62■■■■■ 6.01
CCDC180Q9P1Z9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC52.61■■■■■ 6.01
CCDC180Q9P1Z9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.61■■■■■ 6.01
CCDC180Q9P1Z9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC52.6■■■■■ 6.01
CCDC180Q9P1Z9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.59■■■■■ 6.01
CCDC180Q9P1Z9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC52.58■■■■■ 6.01
CCDC180Q9P1Z9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC52.58■■■■■ 6.01
CCDC180Q9P1Z9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.58■■■■■ 6.01
CCDC180Q9P1Z9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC52.57■■■■■ 6.01
CCDC180Q9P1Z9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC52.57■■■■■ 6.01
CCDC180Q9P1Z9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC52.56■■■■■ 6
CCDC180Q9P1Z9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.56■■■■■ 6
CCDC180Q9P1Z9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC52.56■■■■■ 6
CCDC180Q9P1Z9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC52.55■■■■■ 6
CCDC180Q9P1Z9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC52.55■■■■■ 6
CCDC180Q9P1Z9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC52.54■■■■■ 6
CCDC180Q9P1Z9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.53■■■■■ 6
CCDC180Q9P1Z9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC52.53■■■■■ 6
CCDC180Q9P1Z9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.53■■■■■ 6
CCDC180Q9P1Z9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC52.52■■■■■ 6
CCDC180Q9P1Z9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC52.52■■■■■ 6
CCDC180Q9P1Z9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC52.52■■■■■ 6
CCDC180Q9P1Z9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC52.51■■■■■ 6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms