Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3BP4Q9P0V3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3BP4Q9P0V3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3BP4Q9P0V3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3BP4Q9P0V3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3BP4Q9P0V3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SH3BP4Q9P0V3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SH3BP4Q9P0V3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH3BP4Q9P0V3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SH3BP4Q9P0V3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3BP4Q9P0V3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3BP4Q9P0V3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3BP4Q9P0V3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3BP4Q9P0V3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3BP4Q9P0V3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH3BP4Q9P0V3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH3BP4Q9P0V3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH3BP4Q9P0V3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH3BP4Q9P0V3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH3BP4Q9P0V3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH3BP4Q9P0V3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH3BP4Q9P0V3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3BP4Q9P0V3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3BP4Q9P0V3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3BP4Q9P0V3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3BP4Q9P0V3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3BP4Q9P0V3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3BP4Q9P0V3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3BP4Q9P0V3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3BP4Q9P0V3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3BP4Q9P0V3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SH3BP4Q9P0V3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SH3BP4Q9P0V3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SH3BP4Q9P0V3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SH3BP4Q9P0V3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SH3BP4Q9P0V3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SH3BP4Q9P0V3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SH3BP4Q9P0V3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3BP4Q9P0V3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3BP4Q9P0V3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3BP4Q9P0V3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3BP4Q9P0V3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3BP4Q9P0V3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3BP4Q9P0V3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3BP4Q9P0V3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3BP4Q9P0V3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3BP4Q9P0V3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3BP4Q9P0V3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3BP4Q9P0V3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3BP4Q9P0V3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3BP4Q9P0V3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3BP4Q9P0V3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3BP4Q9P0V3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3BP4Q9P0V3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3BP4Q9P0V3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3BP4Q9P0V3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3BP4Q9P0V3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SH3BP4Q9P0V3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3BP4Q9P0V3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3BP4Q9P0V3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3BP4Q9P0V3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SH3BP4Q9P0V3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3BP4Q9P0V3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3BP4Q9P0V3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3BP4Q9P0V3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3BP4Q9P0V3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3BP4Q9P0V3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3BP4Q9P0V3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SH3BP4Q9P0V3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3BP4Q9P0V3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3BP4Q9P0V3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3BP4Q9P0V3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3BP4Q9P0V3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3BP4Q9P0V3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3BP4Q9P0V3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SH3BP4Q9P0V3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SH3BP4Q9P0V3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3BP4Q9P0V3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3BP4Q9P0V3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3BP4Q9P0V3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3BP4Q9P0V3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3BP4Q9P0V3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3BP4Q9P0V3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SH3BP4Q9P0V3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3BP4Q9P0V3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3BP4Q9P0V3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3BP4Q9P0V3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3BP4Q9P0V3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3BP4Q9P0V3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3BP4Q9P0V3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3BP4Q9P0V3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3BP4Q9P0V3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
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