Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCMF1Q9P0J7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCMF1Q9P0J7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCMF1Q9P0J7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KCMF1Q9P0J7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCMF1Q9P0J7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCMF1Q9P0J7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCMF1Q9P0J7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCMF1Q9P0J7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KCMF1Q9P0J7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCMF1Q9P0J7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCMF1Q9P0J7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCMF1Q9P0J7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCMF1Q9P0J7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCMF1Q9P0J7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCMF1Q9P0J7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCMF1Q9P0J7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCMF1Q9P0J7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCMF1Q9P0J7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCMF1Q9P0J7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCMF1Q9P0J7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCMF1Q9P0J7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCMF1Q9P0J7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
KCMF1Q9P0J7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCMF1Q9P0J7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCMF1Q9P0J7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCMF1Q9P0J7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCMF1Q9P0J7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCMF1Q9P0J7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCMF1Q9P0J7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCMF1Q9P0J7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
KCMF1Q9P0J7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCMF1Q9P0J7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
KCMF1Q9P0J7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCMF1Q9P0J7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCMF1Q9P0J7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCMF1Q9P0J7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCMF1Q9P0J7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCMF1Q9P0J7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCMF1Q9P0J7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCMF1Q9P0J7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCMF1Q9P0J7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCMF1Q9P0J7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCMF1Q9P0J7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCMF1Q9P0J7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCMF1Q9P0J7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCMF1Q9P0J7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCMF1Q9P0J7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCMF1Q9P0J7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCMF1Q9P0J7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KCMF1Q9P0J7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCMF1Q9P0J7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCMF1Q9P0J7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCMF1Q9P0J7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCMF1Q9P0J7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCMF1Q9P0J7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCMF1Q9P0J7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCMF1Q9P0J7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCMF1Q9P0J7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCMF1Q9P0J7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCMF1Q9P0J7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCMF1Q9P0J7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCMF1Q9P0J7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCMF1Q9P0J7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KCMF1Q9P0J7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCMF1Q9P0J7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCMF1Q9P0J7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCMF1Q9P0J7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCMF1Q9P0J7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCMF1Q9P0J7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCMF1Q9P0J7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCMF1Q9P0J7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCMF1Q9P0J7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCMF1Q9P0J7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCMF1Q9P0J7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCMF1Q9P0J7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCMF1Q9P0J7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCMF1Q9P0J7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCMF1Q9P0J7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCMF1Q9P0J7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCMF1Q9P0J7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCMF1Q9P0J7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCMF1Q9P0J7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCMF1Q9P0J7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCMF1Q9P0J7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCMF1Q9P0J7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCMF1Q9P0J7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KCMF1Q9P0J7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCMF1Q9P0J7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCMF1Q9P0J7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCMF1Q9P0J7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCMF1Q9P0J7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KCMF1Q9P0J7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCMF1Q9P0J7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KCMF1Q9P0J7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCMF1Q9P0J7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCMF1Q9P0J7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCMF1Q9P0J7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCMF1Q9P0J7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KCMF1Q9P0J7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms