Protein–RNA interactions for Protein: Q9P086

MED11, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED11Q9P086 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED11Q9P086 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED11Q9P086 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED11Q9P086 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED11Q9P086 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED11Q9P086 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED11Q9P086 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED11Q9P086 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED11Q9P086 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MED11Q9P086 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MED11Q9P086 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MED11Q9P086 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MED11Q9P086 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MED11Q9P086 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MED11Q9P086 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MED11Q9P086 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MED11Q9P086 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MED11Q9P086 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MED11Q9P086 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MED11Q9P086 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MED11Q9P086 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MED11Q9P086 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MED11Q9P086 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MED11Q9P086 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MED11Q9P086 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED11Q9P086 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED11Q9P086 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED11Q9P086 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED11Q9P086 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED11Q9P086 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED11Q9P086 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED11Q9P086 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MED11Q9P086 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MED11Q9P086 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MED11Q9P086 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MED11Q9P086 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MED11Q9P086 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED11Q9P086 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED11Q9P086 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MED11Q9P086 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MED11Q9P086 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MED11Q9P086 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED11Q9P086 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED11Q9P086 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MED11Q9P086 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED11Q9P086 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED11Q9P086 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED11Q9P086 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED11Q9P086 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED11Q9P086 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MED11Q9P086 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MED11Q9P086 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MED11Q9P086 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MED11Q9P086 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MED11Q9P086 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MED11Q9P086 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MED11Q9P086 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MED11Q9P086 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MED11Q9P086 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MED11Q9P086 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MED11Q9P086 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MED11Q9P086 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MED11Q9P086 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MED11Q9P086 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MED11Q9P086 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MED11Q9P086 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MED11Q9P086 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MED11Q9P086 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MED11Q9P086 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MED11Q9P086 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MED11Q9P086 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED11Q9P086 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED11Q9P086 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MED11Q9P086 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MED11Q9P086 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED11Q9P086 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED11Q9P086 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED11Q9P086 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED11Q9P086 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MED11Q9P086 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED11Q9P086 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MED11Q9P086 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED11Q9P086 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED11Q9P086 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED11Q9P086 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MED11Q9P086 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MED11Q9P086 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MED11Q9P086 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MED11Q9P086 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MED11Q9P086 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MED11Q9P086 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MED11Q9P086 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MED11Q9P086 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MED11Q9P086 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MED11Q9P086 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MED11Q9P086 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MED11Q9P086 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MED11Q9P086 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MED11Q9P086 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MED11Q9P086 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms