Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GGA3Q9NZ52 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GGA3Q9NZ52 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GGA3Q9NZ52 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GGA3Q9NZ52 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GGA3Q9NZ52 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GGA3Q9NZ52 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GGA3Q9NZ52 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
GGA3Q9NZ52 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
GGA3Q9NZ52 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GGA3Q9NZ52 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GGA3Q9NZ52 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GGA3Q9NZ52 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GGA3Q9NZ52 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GGA3Q9NZ52 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
GGA3Q9NZ52 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GGA3Q9NZ52 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GGA3Q9NZ52 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GGA3Q9NZ52 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GGA3Q9NZ52 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GGA3Q9NZ52 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GGA3Q9NZ52 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GGA3Q9NZ52 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GGA3Q9NZ52 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GGA3Q9NZ52 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GGA3Q9NZ52 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GGA3Q9NZ52 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GGA3Q9NZ52 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GGA3Q9NZ52 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GGA3Q9NZ52 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GGA3Q9NZ52 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GGA3Q9NZ52 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GGA3Q9NZ52 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GGA3Q9NZ52 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GGA3Q9NZ52 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GGA3Q9NZ52 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GGA3Q9NZ52 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GGA3Q9NZ52 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GGA3Q9NZ52 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GGA3Q9NZ52 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GGA3Q9NZ52 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GGA3Q9NZ52 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GGA3Q9NZ52 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GGA3Q9NZ52 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GGA3Q9NZ52 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GGA3Q9NZ52 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GGA3Q9NZ52 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GGA3Q9NZ52 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GGA3Q9NZ52 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
GGA3Q9NZ52 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GGA3Q9NZ52 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GGA3Q9NZ52 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GGA3Q9NZ52 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
GGA3Q9NZ52 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
GGA3Q9NZ52 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
GGA3Q9NZ52 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
GGA3Q9NZ52 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GGA3Q9NZ52 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GGA3Q9NZ52 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GGA3Q9NZ52 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GGA3Q9NZ52 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GGA3Q9NZ52 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
GGA3Q9NZ52 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GGA3Q9NZ52 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GGA3Q9NZ52 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GGA3Q9NZ52 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GGA3Q9NZ52 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GGA3Q9NZ52 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
GGA3Q9NZ52 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GGA3Q9NZ52 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
GGA3Q9NZ52 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GGA3Q9NZ52 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
GGA3Q9NZ52 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GGA3Q9NZ52 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GGA3Q9NZ52 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GGA3Q9NZ52 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GGA3Q9NZ52 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GGA3Q9NZ52 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GGA3Q9NZ52 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GGA3Q9NZ52 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GGA3Q9NZ52 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GGA3Q9NZ52 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GGA3Q9NZ52 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GGA3Q9NZ52 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
GGA3Q9NZ52 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
GGA3Q9NZ52 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GGA3Q9NZ52 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GGA3Q9NZ52 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GGA3Q9NZ52 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GGA3Q9NZ52 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GGA3Q9NZ52 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GGA3Q9NZ52 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
GGA3Q9NZ52 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GGA3Q9NZ52 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
GGA3Q9NZ52 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GGA3Q9NZ52 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GGA3Q9NZ52 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GGA3Q9NZ52 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GGA3Q9NZ52 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GGA3Q9NZ52 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms