Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1orf109Q9NX04 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
C1orf109Q9NX04 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1orf109Q9NX04 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1orf109Q9NX04 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1orf109Q9NX04 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1orf109Q9NX04 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1orf109Q9NX04 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1orf109Q9NX04 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1orf109Q9NX04 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1orf109Q9NX04 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1orf109Q9NX04 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1orf109Q9NX04 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf109Q9NX04 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf109Q9NX04 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf109Q9NX04 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf109Q9NX04 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1orf109Q9NX04 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1orf109Q9NX04 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1orf109Q9NX04 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1orf109Q9NX04 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1orf109Q9NX04 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1orf109Q9NX04 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1orf109Q9NX04 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1orf109Q9NX04 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1orf109Q9NX04 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1orf109Q9NX04 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1orf109Q9NX04 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1orf109Q9NX04 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1orf109Q9NX04 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1orf109Q9NX04 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1orf109Q9NX04 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1orf109Q9NX04 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1orf109Q9NX04 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C1orf109Q9NX04 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1orf109Q9NX04 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1orf109Q9NX04 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1orf109Q9NX04 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1orf109Q9NX04 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1orf109Q9NX04 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1orf109Q9NX04 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1orf109Q9NX04 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1orf109Q9NX04 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1orf109Q9NX04 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1orf109Q9NX04 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1orf109Q9NX04 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1orf109Q9NX04 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
C1orf109Q9NX04 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1orf109Q9NX04 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1orf109Q9NX04 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1orf109Q9NX04 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1orf109Q9NX04 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1orf109Q9NX04 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1orf109Q9NX04 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1orf109Q9NX04 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C1orf109Q9NX04 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1orf109Q9NX04 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C1orf109Q9NX04 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C1orf109Q9NX04 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24■■□□□ 1.43
C1orf109Q9NX04 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1orf109Q9NX04 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C1orf109Q9NX04 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C1orf109Q9NX04 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C1orf109Q9NX04 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1orf109Q9NX04 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1orf109Q9NX04 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1orf109Q9NX04 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1orf109Q9NX04 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1orf109Q9NX04 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf109Q9NX04 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf109Q9NX04 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf109Q9NX04 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf109Q9NX04 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf109Q9NX04 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf109Q9NX04 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1orf109Q9NX04 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1orf109Q9NX04 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1orf109Q9NX04 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1orf109Q9NX04 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1orf109Q9NX04 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1orf109Q9NX04 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
C1orf109Q9NX04 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C1orf109Q9NX04 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1orf109Q9NX04 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1orf109Q9NX04 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1orf109Q9NX04 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1orf109Q9NX04 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1orf109Q9NX04 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1orf109Q9NX04 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1orf109Q9NX04 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1orf109Q9NX04 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1orf109Q9NX04 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1orf109Q9NX04 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf109Q9NX04 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf109Q9NX04 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf109Q9NX04 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf109Q9NX04 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf109Q9NX04 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1orf109Q9NX04 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1orf109Q9NX04 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms