Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM30AQ9NV96 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM30AQ9NV96 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TMEM30AQ9NV96 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMEM30AQ9NV96 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TMEM30AQ9NV96 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM30AQ9NV96 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM30AQ9NV96 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM30AQ9NV96 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM30AQ9NV96 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM30AQ9NV96 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM30AQ9NV96 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM30AQ9NV96 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM30AQ9NV96 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM30AQ9NV96 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM30AQ9NV96 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM30AQ9NV96 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM30AQ9NV96 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM30AQ9NV96 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM30AQ9NV96 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM30AQ9NV96 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM30AQ9NV96 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM30AQ9NV96 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM30AQ9NV96 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM30AQ9NV96 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM30AQ9NV96 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM30AQ9NV96 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM30AQ9NV96 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMEM30AQ9NV96 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMEM30AQ9NV96 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMEM30AQ9NV96 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMEM30AQ9NV96 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMEM30AQ9NV96 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMEM30AQ9NV96 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMEM30AQ9NV96 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM30AQ9NV96 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM30AQ9NV96 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM30AQ9NV96 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM30AQ9NV96 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM30AQ9NV96 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM30AQ9NV96 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM30AQ9NV96 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM30AQ9NV96 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TMEM30AQ9NV96 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMEM30AQ9NV96 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMEM30AQ9NV96 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMEM30AQ9NV96 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM30AQ9NV96 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM30AQ9NV96 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM30AQ9NV96 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM30AQ9NV96 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM30AQ9NV96 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMEM30AQ9NV96 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMEM30AQ9NV96 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMEM30AQ9NV96 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMEM30AQ9NV96 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM30AQ9NV96 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM30AQ9NV96 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM30AQ9NV96 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM30AQ9NV96 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM30AQ9NV96 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TMEM30AQ9NV96 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM30AQ9NV96 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM30AQ9NV96 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM30AQ9NV96 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM30AQ9NV96 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM30AQ9NV96 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM30AQ9NV96 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM30AQ9NV96 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM30AQ9NV96 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM30AQ9NV96 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM30AQ9NV96 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM30AQ9NV96 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM30AQ9NV96 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM30AQ9NV96 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM30AQ9NV96 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM30AQ9NV96 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM30AQ9NV96 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM30AQ9NV96 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM30AQ9NV96 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM30AQ9NV96 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM30AQ9NV96 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM30AQ9NV96 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM30AQ9NV96 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM30AQ9NV96 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM30AQ9NV96 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM30AQ9NV96 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM30AQ9NV96 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM30AQ9NV96 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM30AQ9NV96 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM30AQ9NV96 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM30AQ9NV96 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM30AQ9NV96 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM30AQ9NV96 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM30AQ9NV96 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM30AQ9NV96 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM30AQ9NV96 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM30AQ9NV96 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM30AQ9NV96 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM30AQ9NV96 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms