Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV79

PCMTD2, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD2Q9NV79 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCMTD2Q9NV79 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCMTD2Q9NV79 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCMTD2Q9NV79 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCMTD2Q9NV79 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCMTD2Q9NV79 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCMTD2Q9NV79 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCMTD2Q9NV79 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCMTD2Q9NV79 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCMTD2Q9NV79 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PCMTD2Q9NV79 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCMTD2Q9NV79 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCMTD2Q9NV79 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCMTD2Q9NV79 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCMTD2Q9NV79 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCMTD2Q9NV79 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCMTD2Q9NV79 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCMTD2Q9NV79 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCMTD2Q9NV79 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCMTD2Q9NV79 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCMTD2Q9NV79 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCMTD2Q9NV79 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCMTD2Q9NV79 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCMTD2Q9NV79 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCMTD2Q9NV79 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCMTD2Q9NV79 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCMTD2Q9NV79 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCMTD2Q9NV79 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCMTD2Q9NV79 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCMTD2Q9NV79 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCMTD2Q9NV79 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCMTD2Q9NV79 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCMTD2Q9NV79 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCMTD2Q9NV79 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCMTD2Q9NV79 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PCMTD2Q9NV79 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PCMTD2Q9NV79 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCMTD2Q9NV79 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCMTD2Q9NV79 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCMTD2Q9NV79 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PCMTD2Q9NV79 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PCMTD2Q9NV79 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCMTD2Q9NV79 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCMTD2Q9NV79 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCMTD2Q9NV79 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCMTD2Q9NV79 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCMTD2Q9NV79 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCMTD2Q9NV79 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCMTD2Q9NV79 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCMTD2Q9NV79 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCMTD2Q9NV79 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCMTD2Q9NV79 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCMTD2Q9NV79 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCMTD2Q9NV79 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCMTD2Q9NV79 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PCMTD2Q9NV79 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCMTD2Q9NV79 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCMTD2Q9NV79 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCMTD2Q9NV79 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCMTD2Q9NV79 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PCMTD2Q9NV79 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCMTD2Q9NV79 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCMTD2Q9NV79 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCMTD2Q9NV79 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCMTD2Q9NV79 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCMTD2Q9NV79 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCMTD2Q9NV79 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCMTD2Q9NV79 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCMTD2Q9NV79 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCMTD2Q9NV79 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCMTD2Q9NV79 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PCMTD2Q9NV79 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCMTD2Q9NV79 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCMTD2Q9NV79 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCMTD2Q9NV79 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCMTD2Q9NV79 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCMTD2Q9NV79 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCMTD2Q9NV79 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCMTD2Q9NV79 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCMTD2Q9NV79 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCMTD2Q9NV79 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCMTD2Q9NV79 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCMTD2Q9NV79 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PCMTD2Q9NV79 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCMTD2Q9NV79 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PCMTD2Q9NV79 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PCMTD2Q9NV79 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCMTD2Q9NV79 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCMTD2Q9NV79 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCMTD2Q9NV79 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCMTD2Q9NV79 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCMTD2Q9NV79 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCMTD2Q9NV79 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCMTD2Q9NV79 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCMTD2Q9NV79 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCMTD2Q9NV79 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCMTD2Q9NV79 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCMTD2Q9NV79 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCMTD2Q9NV79 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCMTD2Q9NV79 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms