Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV64

TMEM39A, Transmembrane protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39AQ9NV64 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMEM39AQ9NV64 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMEM39AQ9NV64 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TMEM39AQ9NV64 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TMEM39AQ9NV64 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TMEM39AQ9NV64 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM39AQ9NV64 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMEM39AQ9NV64 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM39AQ9NV64 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM39AQ9NV64 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM39AQ9NV64 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM39AQ9NV64 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMEM39AQ9NV64 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TMEM39AQ9NV64 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TMEM39AQ9NV64 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMEM39AQ9NV64 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMEM39AQ9NV64 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM39AQ9NV64 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM39AQ9NV64 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM39AQ9NV64 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMEM39AQ9NV64 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMEM39AQ9NV64 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TMEM39AQ9NV64 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMEM39AQ9NV64 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM39AQ9NV64 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM39AQ9NV64 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM39AQ9NV64 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM39AQ9NV64 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM39AQ9NV64 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM39AQ9NV64 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM39AQ9NV64 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM39AQ9NV64 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM39AQ9NV64 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM39AQ9NV64 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM39AQ9NV64 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM39AQ9NV64 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM39AQ9NV64 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM39AQ9NV64 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM39AQ9NV64 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM39AQ9NV64 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM39AQ9NV64 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM39AQ9NV64 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM39AQ9NV64 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMEM39AQ9NV64 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMEM39AQ9NV64 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TMEM39AQ9NV64 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TMEM39AQ9NV64 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM39AQ9NV64 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM39AQ9NV64 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM39AQ9NV64 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM39AQ9NV64 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMEM39AQ9NV64 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMEM39AQ9NV64 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMEM39AQ9NV64 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMEM39AQ9NV64 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMEM39AQ9NV64 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM39AQ9NV64 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM39AQ9NV64 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM39AQ9NV64 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM39AQ9NV64 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMEM39AQ9NV64 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMEM39AQ9NV64 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TMEM39AQ9NV64 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMEM39AQ9NV64 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMEM39AQ9NV64 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMEM39AQ9NV64 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMEM39AQ9NV64 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMEM39AQ9NV64 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMEM39AQ9NV64 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TMEM39AQ9NV64 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TMEM39AQ9NV64 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMEM39AQ9NV64 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMEM39AQ9NV64 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TMEM39AQ9NV64 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TMEM39AQ9NV64 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMEM39AQ9NV64 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMEM39AQ9NV64 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM39AQ9NV64 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM39AQ9NV64 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM39AQ9NV64 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM39AQ9NV64 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM39AQ9NV64 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMEM39AQ9NV64 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMEM39AQ9NV64 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMEM39AQ9NV64 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMEM39AQ9NV64 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMEM39AQ9NV64 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TMEM39AQ9NV64 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMEM39AQ9NV64 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMEM39AQ9NV64 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMEM39AQ9NV64 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMEM39AQ9NV64 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TMEM39AQ9NV64 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMEM39AQ9NV64 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMEM39AQ9NV64 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMEM39AQ9NV64 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMEM39AQ9NV64 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMEM39AQ9NV64 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMEM39AQ9NV64 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMEM39AQ9NV64 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms