Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTN9

SEMA4G, Semaphorin-4G, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4GQ9NTN9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA4GQ9NTN9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA4GQ9NTN9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA4GQ9NTN9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA4GQ9NTN9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA4GQ9NTN9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA4GQ9NTN9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA4GQ9NTN9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA4GQ9NTN9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA4GQ9NTN9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA4GQ9NTN9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA4GQ9NTN9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA4GQ9NTN9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SEMA4GQ9NTN9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SEMA4GQ9NTN9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA4GQ9NTN9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA4GQ9NTN9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA4GQ9NTN9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA4GQ9NTN9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA4GQ9NTN9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA4GQ9NTN9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA4GQ9NTN9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA4GQ9NTN9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA4GQ9NTN9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA4GQ9NTN9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA4GQ9NTN9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA4GQ9NTN9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA4GQ9NTN9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA4GQ9NTN9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA4GQ9NTN9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA4GQ9NTN9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA4GQ9NTN9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA4GQ9NTN9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA4GQ9NTN9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA4GQ9NTN9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA4GQ9NTN9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA4GQ9NTN9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA4GQ9NTN9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA4GQ9NTN9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA4GQ9NTN9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA4GQ9NTN9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA4GQ9NTN9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA4GQ9NTN9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA4GQ9NTN9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA4GQ9NTN9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SEMA4GQ9NTN9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA4GQ9NTN9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA4GQ9NTN9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA4GQ9NTN9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA4GQ9NTN9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA4GQ9NTN9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA4GQ9NTN9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA4GQ9NTN9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA4GQ9NTN9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA4GQ9NTN9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA4GQ9NTN9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA4GQ9NTN9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA4GQ9NTN9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA4GQ9NTN9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA4GQ9NTN9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SEMA4GQ9NTN9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEMA4GQ9NTN9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA4GQ9NTN9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA4GQ9NTN9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA4GQ9NTN9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA4GQ9NTN9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA4GQ9NTN9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA4GQ9NTN9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA4GQ9NTN9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA4GQ9NTN9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA4GQ9NTN9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA4GQ9NTN9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA4GQ9NTN9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA4GQ9NTN9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA4GQ9NTN9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA4GQ9NTN9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA4GQ9NTN9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA4GQ9NTN9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA4GQ9NTN9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA4GQ9NTN9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA4GQ9NTN9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA4GQ9NTN9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA4GQ9NTN9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA4GQ9NTN9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA4GQ9NTN9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA4GQ9NTN9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA4GQ9NTN9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA4GQ9NTN9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA4GQ9NTN9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA4GQ9NTN9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA4GQ9NTN9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA4GQ9NTN9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA4GQ9NTN9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA4GQ9NTN9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA4GQ9NTN9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA4GQ9NTN9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA4GQ9NTN9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA4GQ9NTN9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA4GQ9NTN9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA4GQ9NTN9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms