Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
SMC4Q9NTJ3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SMC4Q9NTJ3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMC4Q9NTJ3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMC4Q9NTJ3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMC4Q9NTJ3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SMC4Q9NTJ3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
SMC4Q9NTJ3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SMC4Q9NTJ3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SMC4Q9NTJ3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SMC4Q9NTJ3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SMC4Q9NTJ3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SMC4Q9NTJ3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SMC4Q9NTJ3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SMC4Q9NTJ3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SMC4Q9NTJ3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SMC4Q9NTJ3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SMC4Q9NTJ3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SMC4Q9NTJ3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SMC4Q9NTJ3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SMC4Q9NTJ3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SMC4Q9NTJ3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SMC4Q9NTJ3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SMC4Q9NTJ3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
SMC4Q9NTJ3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
SMC4Q9NTJ3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SMC4Q9NTJ3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SMC4Q9NTJ3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SMC4Q9NTJ3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SMC4Q9NTJ3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SMC4Q9NTJ3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SMC4Q9NTJ3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SMC4Q9NTJ3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SMC4Q9NTJ3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SMC4Q9NTJ3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SMC4Q9NTJ3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SMC4Q9NTJ3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SMC4Q9NTJ3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SMC4Q9NTJ3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SMC4Q9NTJ3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SMC4Q9NTJ3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
SMC4Q9NTJ3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SMC4Q9NTJ3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SMC4Q9NTJ3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SMC4Q9NTJ3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SMC4Q9NTJ3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SMC4Q9NTJ3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SMC4Q9NTJ3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SMC4Q9NTJ3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SMC4Q9NTJ3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SMC4Q9NTJ3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SMC4Q9NTJ3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SMC4Q9NTJ3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SMC4Q9NTJ3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SMC4Q9NTJ3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SMC4Q9NTJ3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SMC4Q9NTJ3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SMC4Q9NTJ3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SMC4Q9NTJ3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SMC4Q9NTJ3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SMC4Q9NTJ3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SMC4Q9NTJ3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SMC4Q9NTJ3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SMC4Q9NTJ3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SMC4Q9NTJ3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SMC4Q9NTJ3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SMC4Q9NTJ3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SMC4Q9NTJ3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
SMC4Q9NTJ3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
SMC4Q9NTJ3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SMC4Q9NTJ3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SMC4Q9NTJ3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SMC4Q9NTJ3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SMC4Q9NTJ3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SMC4Q9NTJ3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SMC4Q9NTJ3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SMC4Q9NTJ3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SMC4Q9NTJ3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SMC4Q9NTJ3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SMC4Q9NTJ3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SMC4Q9NTJ3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SMC4Q9NTJ3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SMC4Q9NTJ3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SMC4Q9NTJ3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SMC4Q9NTJ3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SMC4Q9NTJ3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SMC4Q9NTJ3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SMC4Q9NTJ3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.73
SMC4Q9NTJ3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SMC4Q9NTJ3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SMC4Q9NTJ3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SMC4Q9NTJ3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SMC4Q9NTJ3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SMC4Q9NTJ3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SMC4Q9NTJ3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SMC4Q9NTJ3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SMC4Q9NTJ3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SMC4Q9NTJ3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SMC4Q9NTJ3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SMC4Q9NTJ3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms