Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TM7SF3Q9NS93 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM7SF3Q9NS93 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM7SF3Q9NS93 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TM7SF3Q9NS93 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM7SF3Q9NS93 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TM7SF3Q9NS93 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM7SF3Q9NS93 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM7SF3Q9NS93 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM7SF3Q9NS93 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM7SF3Q9NS93 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TM7SF3Q9NS93 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TM7SF3Q9NS93 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TM7SF3Q9NS93 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TM7SF3Q9NS93 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TM7SF3Q9NS93 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TM7SF3Q9NS93 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TM7SF3Q9NS93 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TM7SF3Q9NS93 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TM7SF3Q9NS93 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TM7SF3Q9NS93 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TM7SF3Q9NS93 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TM7SF3Q9NS93 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TM7SF3Q9NS93 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TM7SF3Q9NS93 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TM7SF3Q9NS93 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TM7SF3Q9NS93 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TM7SF3Q9NS93 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TM7SF3Q9NS93 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TM7SF3Q9NS93 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TM7SF3Q9NS93 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TM7SF3Q9NS93 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TM7SF3Q9NS93 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TM7SF3Q9NS93 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TM7SF3Q9NS93 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TM7SF3Q9NS93 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TM7SF3Q9NS93 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TM7SF3Q9NS93 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TM7SF3Q9NS93 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TM7SF3Q9NS93 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TM7SF3Q9NS93 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TM7SF3Q9NS93 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TM7SF3Q9NS93 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TM7SF3Q9NS93 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TM7SF3Q9NS93 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TM7SF3Q9NS93 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TM7SF3Q9NS93 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TM7SF3Q9NS93 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TM7SF3Q9NS93 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TM7SF3Q9NS93 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TM7SF3Q9NS93 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TM7SF3Q9NS93 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM7SF3Q9NS93 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM7SF3Q9NS93 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM7SF3Q9NS93 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM7SF3Q9NS93 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM7SF3Q9NS93 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TM7SF3Q9NS93 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TM7SF3Q9NS93 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TM7SF3Q9NS93 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TM7SF3Q9NS93 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TM7SF3Q9NS93 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TM7SF3Q9NS93 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TM7SF3Q9NS93 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TM7SF3Q9NS93 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TM7SF3Q9NS93 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TM7SF3Q9NS93 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TM7SF3Q9NS93 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TM7SF3Q9NS93 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TM7SF3Q9NS93 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TM7SF3Q9NS93 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TM7SF3Q9NS93 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TM7SF3Q9NS93 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TM7SF3Q9NS93 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TM7SF3Q9NS93 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TM7SF3Q9NS93 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TM7SF3Q9NS93 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TM7SF3Q9NS93 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TM7SF3Q9NS93 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TM7SF3Q9NS93 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TM7SF3Q9NS93 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TM7SF3Q9NS93 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TM7SF3Q9NS93 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TM7SF3Q9NS93 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TM7SF3Q9NS93 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TM7SF3Q9NS93 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TM7SF3Q9NS93 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM7SF3Q9NS93 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM7SF3Q9NS93 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TM7SF3Q9NS93 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM7SF3Q9NS93 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TM7SF3Q9NS93 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TM7SF3Q9NS93 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TM7SF3Q9NS93 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TM7SF3Q9NS93 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TM7SF3Q9NS93 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM7SF3Q9NS93 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM7SF3Q9NS93 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM7SF3Q9NS93 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TM7SF3Q9NS93 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms