Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG0

CHRAC1, Chromatin accessibility complex protein 1, humanhuman

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Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRAC1Q9NRG0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRAC1Q9NRG0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRAC1Q9NRG0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRAC1Q9NRG0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRAC1Q9NRG0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRAC1Q9NRG0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRAC1Q9NRG0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHRAC1Q9NRG0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHRAC1Q9NRG0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CHRAC1Q9NRG0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRAC1Q9NRG0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRAC1Q9NRG0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHRAC1Q9NRG0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRAC1Q9NRG0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRAC1Q9NRG0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRAC1Q9NRG0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRAC1Q9NRG0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRAC1Q9NRG0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRAC1Q9NRG0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRAC1Q9NRG0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRAC1Q9NRG0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRAC1Q9NRG0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHRAC1Q9NRG0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRAC1Q9NRG0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRAC1Q9NRG0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRAC1Q9NRG0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHRAC1Q9NRG0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRAC1Q9NRG0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRAC1Q9NRG0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRAC1Q9NRG0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRAC1Q9NRG0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRAC1Q9NRG0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRAC1Q9NRG0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRAC1Q9NRG0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRAC1Q9NRG0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRAC1Q9NRG0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRAC1Q9NRG0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRAC1Q9NRG0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRAC1Q9NRG0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRAC1Q9NRG0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRAC1Q9NRG0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRAC1Q9NRG0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRAC1Q9NRG0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRAC1Q9NRG0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRAC1Q9NRG0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRAC1Q9NRG0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRAC1Q9NRG0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRAC1Q9NRG0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRAC1Q9NRG0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRAC1Q9NRG0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRAC1Q9NRG0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRAC1Q9NRG0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRAC1Q9NRG0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRAC1Q9NRG0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRAC1Q9NRG0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRAC1Q9NRG0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRAC1Q9NRG0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRAC1Q9NRG0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRAC1Q9NRG0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHRAC1Q9NRG0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CHRAC1Q9NRG0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRAC1Q9NRG0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRAC1Q9NRG0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRAC1Q9NRG0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRAC1Q9NRG0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRAC1Q9NRG0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRAC1Q9NRG0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRAC1Q9NRG0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRAC1Q9NRG0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRAC1Q9NRG0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRAC1Q9NRG0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRAC1Q9NRG0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRAC1Q9NRG0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRAC1Q9NRG0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRAC1Q9NRG0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRAC1Q9NRG0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRAC1Q9NRG0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRAC1Q9NRG0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRAC1Q9NRG0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRAC1Q9NRG0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRAC1Q9NRG0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRAC1Q9NRG0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRAC1Q9NRG0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRAC1Q9NRG0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRAC1Q9NRG0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRAC1Q9NRG0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRAC1Q9NRG0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRAC1Q9NRG0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRAC1Q9NRG0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRAC1Q9NRG0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRAC1Q9NRG0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRAC1Q9NRG0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRAC1Q9NRG0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRAC1Q9NRG0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRAC1Q9NRG0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRAC1Q9NRG0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRAC1Q9NRG0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRAC1Q9NRG0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRAC1Q9NRG0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRAC1Q9NRG0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
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