Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR33

POLE4, DNA polymerase epsilon subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE4Q9NR33 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLE4Q9NR33 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
POLE4Q9NR33 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
POLE4Q9NR33 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLE4Q9NR33 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLE4Q9NR33 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLE4Q9NR33 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLE4Q9NR33 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLE4Q9NR33 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLE4Q9NR33 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLE4Q9NR33 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLE4Q9NR33 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLE4Q9NR33 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLE4Q9NR33 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLE4Q9NR33 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLE4Q9NR33 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLE4Q9NR33 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POLE4Q9NR33 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLE4Q9NR33 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLE4Q9NR33 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLE4Q9NR33 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLE4Q9NR33 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLE4Q9NR33 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLE4Q9NR33 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLE4Q9NR33 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLE4Q9NR33 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLE4Q9NR33 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLE4Q9NR33 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLE4Q9NR33 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLE4Q9NR33 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLE4Q9NR33 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLE4Q9NR33 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
POLE4Q9NR33 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLE4Q9NR33 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLE4Q9NR33 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLE4Q9NR33 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLE4Q9NR33 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLE4Q9NR33 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLE4Q9NR33 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLE4Q9NR33 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLE4Q9NR33 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLE4Q9NR33 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLE4Q9NR33 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLE4Q9NR33 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POLE4Q9NR33 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLE4Q9NR33 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLE4Q9NR33 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLE4Q9NR33 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLE4Q9NR33 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLE4Q9NR33 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLE4Q9NR33 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLE4Q9NR33 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLE4Q9NR33 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLE4Q9NR33 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLE4Q9NR33 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLE4Q9NR33 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLE4Q9NR33 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLE4Q9NR33 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
POLE4Q9NR33 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
POLE4Q9NR33 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLE4Q9NR33 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
POLE4Q9NR33 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLE4Q9NR33 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLE4Q9NR33 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLE4Q9NR33 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLE4Q9NR33 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLE4Q9NR33 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLE4Q9NR33 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLE4Q9NR33 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLE4Q9NR33 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLE4Q9NR33 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLE4Q9NR33 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLE4Q9NR33 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLE4Q9NR33 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLE4Q9NR33 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLE4Q9NR33 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLE4Q9NR33 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLE4Q9NR33 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLE4Q9NR33 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLE4Q9NR33 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLE4Q9NR33 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLE4Q9NR33 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLE4Q9NR33 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLE4Q9NR33 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLE4Q9NR33 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLE4Q9NR33 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLE4Q9NR33 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLE4Q9NR33 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLE4Q9NR33 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLE4Q9NR33 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLE4Q9NR33 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
POLE4Q9NR33 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLE4Q9NR33 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
POLE4Q9NR33 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLE4Q9NR33 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLE4Q9NR33 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLE4Q9NR33 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLE4Q9NR33 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLE4Q9NR33 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLE4Q9NR33 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms