Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GDF3Q9NR23 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GDF3Q9NR23 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GDF3Q9NR23 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GDF3Q9NR23 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GDF3Q9NR23 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GDF3Q9NR23 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GDF3Q9NR23 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GDF3Q9NR23 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GDF3Q9NR23 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GDF3Q9NR23 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GDF3Q9NR23 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GDF3Q9NR23 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GDF3Q9NR23 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GDF3Q9NR23 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GDF3Q9NR23 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GDF3Q9NR23 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GDF3Q9NR23 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GDF3Q9NR23 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GDF3Q9NR23 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GDF3Q9NR23 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GDF3Q9NR23 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GDF3Q9NR23 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GDF3Q9NR23 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GDF3Q9NR23 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GDF3Q9NR23 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GDF3Q9NR23 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GDF3Q9NR23 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GDF3Q9NR23 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GDF3Q9NR23 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GDF3Q9NR23 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GDF3Q9NR23 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GDF3Q9NR23 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GDF3Q9NR23 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GDF3Q9NR23 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GDF3Q9NR23 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GDF3Q9NR23 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GDF3Q9NR23 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GDF3Q9NR23 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GDF3Q9NR23 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GDF3Q9NR23 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GDF3Q9NR23 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GDF3Q9NR23 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GDF3Q9NR23 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GDF3Q9NR23 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GDF3Q9NR23 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GDF3Q9NR23 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GDF3Q9NR23 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GDF3Q9NR23 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GDF3Q9NR23 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GDF3Q9NR23 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GDF3Q9NR23 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GDF3Q9NR23 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GDF3Q9NR23 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GDF3Q9NR23 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GDF3Q9NR23 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GDF3Q9NR23 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GDF3Q9NR23 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GDF3Q9NR23 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GDF3Q9NR23 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GDF3Q9NR23 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GDF3Q9NR23 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GDF3Q9NR23 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GDF3Q9NR23 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GDF3Q9NR23 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GDF3Q9NR23 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GDF3Q9NR23 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GDF3Q9NR23 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GDF3Q9NR23 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GDF3Q9NR23 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GDF3Q9NR23 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GDF3Q9NR23 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GDF3Q9NR23 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GDF3Q9NR23 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GDF3Q9NR23 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GDF3Q9NR23 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GDF3Q9NR23 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GDF3Q9NR23 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GDF3Q9NR23 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GDF3Q9NR23 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GDF3Q9NR23 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GDF3Q9NR23 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GDF3Q9NR23 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GDF3Q9NR23 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GDF3Q9NR23 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GDF3Q9NR23 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GDF3Q9NR23 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GDF3Q9NR23 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GDF3Q9NR23 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
GDF3Q9NR23 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GDF3Q9NR23 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
GDF3Q9NR23 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GDF3Q9NR23 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GDF3Q9NR23 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GDF3Q9NR23 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GDF3Q9NR23 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GDF3Q9NR23 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GDF3Q9NR23 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
GDF3Q9NR23 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GDF3Q9NR23 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 611.7 ms