Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW5

PRDM7, Probable histone-lysine N-methyltransferase PRDM7, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM7Q9NQW5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM7Q9NQW5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM7Q9NQW5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM7Q9NQW5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM7Q9NQW5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM7Q9NQW5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRDM7Q9NQW5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM7Q9NQW5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM7Q9NQW5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM7Q9NQW5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM7Q9NQW5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM7Q9NQW5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRDM7Q9NQW5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDM7Q9NQW5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDM7Q9NQW5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDM7Q9NQW5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDM7Q9NQW5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDM7Q9NQW5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM7Q9NQW5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDM7Q9NQW5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDM7Q9NQW5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDM7Q9NQW5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDM7Q9NQW5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM7Q9NQW5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM7Q9NQW5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM7Q9NQW5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM7Q9NQW5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM7Q9NQW5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRDM7Q9NQW5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRDM7Q9NQW5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM7Q9NQW5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM7Q9NQW5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM7Q9NQW5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM7Q9NQW5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM7Q9NQW5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM7Q9NQW5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM7Q9NQW5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM7Q9NQW5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM7Q9NQW5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM7Q9NQW5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM7Q9NQW5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM7Q9NQW5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM7Q9NQW5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM7Q9NQW5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM7Q9NQW5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM7Q9NQW5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM7Q9NQW5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM7Q9NQW5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM7Q9NQW5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM7Q9NQW5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM7Q9NQW5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM7Q9NQW5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM7Q9NQW5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRDM7Q9NQW5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRDM7Q9NQW5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRDM7Q9NQW5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRDM7Q9NQW5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM7Q9NQW5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM7Q9NQW5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM7Q9NQW5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM7Q9NQW5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM7Q9NQW5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM7Q9NQW5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM7Q9NQW5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM7Q9NQW5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM7Q9NQW5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM7Q9NQW5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRDM7Q9NQW5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM7Q9NQW5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM7Q9NQW5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM7Q9NQW5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PRDM7Q9NQW5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRDM7Q9NQW5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRDM7Q9NQW5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRDM7Q9NQW5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM7Q9NQW5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM7Q9NQW5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM7Q9NQW5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM7Q9NQW5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRDM7Q9NQW5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM7Q9NQW5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM7Q9NQW5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM7Q9NQW5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM7Q9NQW5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM7Q9NQW5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM7Q9NQW5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRDM7Q9NQW5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM7Q9NQW5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM7Q9NQW5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM7Q9NQW5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM7Q9NQW5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM7Q9NQW5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM7Q9NQW5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRDM7Q9NQW5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM7Q9NQW5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM7Q9NQW5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM7Q9NQW5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM7Q9NQW5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRDM7Q9NQW5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM7Q9NQW5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms