Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT6

FSCN3, Fascin-3, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN3Q9NQT6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FSCN3Q9NQT6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FSCN3Q9NQT6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FSCN3Q9NQT6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FSCN3Q9NQT6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FSCN3Q9NQT6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FSCN3Q9NQT6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FSCN3Q9NQT6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FSCN3Q9NQT6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FSCN3Q9NQT6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FSCN3Q9NQT6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FSCN3Q9NQT6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FSCN3Q9NQT6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FSCN3Q9NQT6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FSCN3Q9NQT6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FSCN3Q9NQT6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FSCN3Q9NQT6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FSCN3Q9NQT6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FSCN3Q9NQT6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FSCN3Q9NQT6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FSCN3Q9NQT6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FSCN3Q9NQT6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FSCN3Q9NQT6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FSCN3Q9NQT6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FSCN3Q9NQT6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FSCN3Q9NQT6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FSCN3Q9NQT6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FSCN3Q9NQT6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FSCN3Q9NQT6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FSCN3Q9NQT6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FSCN3Q9NQT6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FSCN3Q9NQT6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FSCN3Q9NQT6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FSCN3Q9NQT6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FSCN3Q9NQT6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FSCN3Q9NQT6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FSCN3Q9NQT6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FSCN3Q9NQT6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FSCN3Q9NQT6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FSCN3Q9NQT6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FSCN3Q9NQT6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FSCN3Q9NQT6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FSCN3Q9NQT6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FSCN3Q9NQT6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FSCN3Q9NQT6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FSCN3Q9NQT6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FSCN3Q9NQT6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FSCN3Q9NQT6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FSCN3Q9NQT6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FSCN3Q9NQT6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FSCN3Q9NQT6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FSCN3Q9NQT6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FSCN3Q9NQT6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FSCN3Q9NQT6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FSCN3Q9NQT6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FSCN3Q9NQT6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FSCN3Q9NQT6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FSCN3Q9NQT6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FSCN3Q9NQT6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FSCN3Q9NQT6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FSCN3Q9NQT6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FSCN3Q9NQT6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
FSCN3Q9NQT6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
FSCN3Q9NQT6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FSCN3Q9NQT6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FSCN3Q9NQT6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FSCN3Q9NQT6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FSCN3Q9NQT6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FSCN3Q9NQT6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FSCN3Q9NQT6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FSCN3Q9NQT6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FSCN3Q9NQT6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FSCN3Q9NQT6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FSCN3Q9NQT6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FSCN3Q9NQT6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
FSCN3Q9NQT6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FSCN3Q9NQT6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FSCN3Q9NQT6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FSCN3Q9NQT6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FSCN3Q9NQT6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FSCN3Q9NQT6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FSCN3Q9NQT6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
FSCN3Q9NQT6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
FSCN3Q9NQT6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FSCN3Q9NQT6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FSCN3Q9NQT6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FSCN3Q9NQT6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FSCN3Q9NQT6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FSCN3Q9NQT6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FSCN3Q9NQT6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FSCN3Q9NQT6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FSCN3Q9NQT6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FSCN3Q9NQT6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FSCN3Q9NQT6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FSCN3Q9NQT6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FSCN3Q9NQT6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FSCN3Q9NQT6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FSCN3Q9NQT6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FSCN3Q9NQT6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FSCN3Q9NQT6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms