Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LHX9Q9NQ69 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LHX9Q9NQ69 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LHX9Q9NQ69 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LHX9Q9NQ69 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LHX9Q9NQ69 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LHX9Q9NQ69 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LHX9Q9NQ69 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LHX9Q9NQ69 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LHX9Q9NQ69 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LHX9Q9NQ69 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LHX9Q9NQ69 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LHX9Q9NQ69 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LHX9Q9NQ69 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LHX9Q9NQ69 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LHX9Q9NQ69 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LHX9Q9NQ69 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LHX9Q9NQ69 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LHX9Q9NQ69 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LHX9Q9NQ69 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LHX9Q9NQ69 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LHX9Q9NQ69 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LHX9Q9NQ69 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LHX9Q9NQ69 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LHX9Q9NQ69 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LHX9Q9NQ69 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LHX9Q9NQ69 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LHX9Q9NQ69 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LHX9Q9NQ69 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LHX9Q9NQ69 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LHX9Q9NQ69 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LHX9Q9NQ69 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LHX9Q9NQ69 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LHX9Q9NQ69 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LHX9Q9NQ69 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LHX9Q9NQ69 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LHX9Q9NQ69 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LHX9Q9NQ69 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LHX9Q9NQ69 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LHX9Q9NQ69 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LHX9Q9NQ69 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LHX9Q9NQ69 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LHX9Q9NQ69 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LHX9Q9NQ69 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LHX9Q9NQ69 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LHX9Q9NQ69 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LHX9Q9NQ69 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LHX9Q9NQ69 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LHX9Q9NQ69 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LHX9Q9NQ69 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LHX9Q9NQ69 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LHX9Q9NQ69 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LHX9Q9NQ69 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LHX9Q9NQ69 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LHX9Q9NQ69 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LHX9Q9NQ69 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LHX9Q9NQ69 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LHX9Q9NQ69 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LHX9Q9NQ69 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LHX9Q9NQ69 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LHX9Q9NQ69 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LHX9Q9NQ69 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LHX9Q9NQ69 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LHX9Q9NQ69 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LHX9Q9NQ69 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LHX9Q9NQ69 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LHX9Q9NQ69 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LHX9Q9NQ69 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LHX9Q9NQ69 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LHX9Q9NQ69 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LHX9Q9NQ69 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LHX9Q9NQ69 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LHX9Q9NQ69 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LHX9Q9NQ69 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LHX9Q9NQ69 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LHX9Q9NQ69 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LHX9Q9NQ69 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LHX9Q9NQ69 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LHX9Q9NQ69 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LHX9Q9NQ69 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LHX9Q9NQ69 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LHX9Q9NQ69 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LHX9Q9NQ69 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LHX9Q9NQ69 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LHX9Q9NQ69 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LHX9Q9NQ69 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LHX9Q9NQ69 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LHX9Q9NQ69 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LHX9Q9NQ69 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LHX9Q9NQ69 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LHX9Q9NQ69 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LHX9Q9NQ69 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LHX9Q9NQ69 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LHX9Q9NQ69 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LHX9Q9NQ69 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LHX9Q9NQ69 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LHX9Q9NQ69 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LHX9Q9NQ69 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LHX9Q9NQ69 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LHX9Q9NQ69 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms