Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC52A3Q9NQ40 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC52A3Q9NQ40 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC52A3Q9NQ40 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC52A3Q9NQ40 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC52A3Q9NQ40 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC52A3Q9NQ40 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC52A3Q9NQ40 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC52A3Q9NQ40 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC52A3Q9NQ40 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC52A3Q9NQ40 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC52A3Q9NQ40 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC52A3Q9NQ40 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC52A3Q9NQ40 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC52A3Q9NQ40 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC52A3Q9NQ40 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC52A3Q9NQ40 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC52A3Q9NQ40 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC52A3Q9NQ40 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC52A3Q9NQ40 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC52A3Q9NQ40 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC52A3Q9NQ40 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC52A3Q9NQ40 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC52A3Q9NQ40 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC52A3Q9NQ40 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC52A3Q9NQ40 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC52A3Q9NQ40 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC52A3Q9NQ40 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC52A3Q9NQ40 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC52A3Q9NQ40 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC52A3Q9NQ40 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC52A3Q9NQ40 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC52A3Q9NQ40 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC52A3Q9NQ40 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC52A3Q9NQ40 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC52A3Q9NQ40 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC52A3Q9NQ40 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC52A3Q9NQ40 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC52A3Q9NQ40 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC52A3Q9NQ40 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC52A3Q9NQ40 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC52A3Q9NQ40 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC52A3Q9NQ40 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC52A3Q9NQ40 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC52A3Q9NQ40 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC52A3Q9NQ40 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC52A3Q9NQ40 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC52A3Q9NQ40 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC52A3Q9NQ40 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC52A3Q9NQ40 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC52A3Q9NQ40 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC52A3Q9NQ40 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC52A3Q9NQ40 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC52A3Q9NQ40 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC52A3Q9NQ40 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC52A3Q9NQ40 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC52A3Q9NQ40 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC52A3Q9NQ40 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC52A3Q9NQ40 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC52A3Q9NQ40 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC52A3Q9NQ40 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC52A3Q9NQ40 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC52A3Q9NQ40 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC52A3Q9NQ40 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC52A3Q9NQ40 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC52A3Q9NQ40 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC52A3Q9NQ40 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC52A3Q9NQ40 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC52A3Q9NQ40 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC52A3Q9NQ40 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC52A3Q9NQ40 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC52A3Q9NQ40 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC52A3Q9NQ40 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC52A3Q9NQ40 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC52A3Q9NQ40 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC52A3Q9NQ40 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC52A3Q9NQ40 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC52A3Q9NQ40 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC52A3Q9NQ40 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC52A3Q9NQ40 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC52A3Q9NQ40 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC52A3Q9NQ40 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC52A3Q9NQ40 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC52A3Q9NQ40 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC52A3Q9NQ40 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC52A3Q9NQ40 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC52A3Q9NQ40 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC52A3Q9NQ40 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC52A3Q9NQ40 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC52A3Q9NQ40 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC52A3Q9NQ40 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC52A3Q9NQ40 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC52A3Q9NQ40 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC52A3Q9NQ40 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC52A3Q9NQ40 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC52A3Q9NQ40 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC52A3Q9NQ40 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC52A3Q9NQ40 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC52A3Q9NQ40 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC52A3Q9NQ40 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms