Protein–RNA interactions for Protein: Q9N2J8

HERV-H_2q24.1 provirus ancestral Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9N2J8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q9N2J8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9N2J8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9N2J8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9N2J8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9N2J8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9N2J8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9N2J8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9N2J8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9N2J8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q9N2J8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q9N2J8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q9N2J8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9N2J8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9N2J8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9N2J8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q9N2J8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9N2J8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9N2J8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9N2J8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9N2J8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9N2J8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9N2J8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9N2J8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9N2J8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9N2J8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9N2J8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9N2J8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9N2J8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9N2J8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9N2J8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9N2J8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9N2J8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9N2J8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9N2J8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9N2J8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9N2J8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9N2J8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9N2J8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9N2J8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9N2J8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9N2J8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9N2J8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9N2J8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9N2J8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9N2J8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9N2J8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9N2J8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9N2J8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9N2J8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9N2J8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9N2J8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9N2J8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9N2J8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9N2J8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9N2J8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9N2J8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9N2J8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9N2J8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9N2J8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9N2J8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9N2J8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9N2J8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9N2J8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9N2J8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9N2J8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9N2J8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9N2J8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9N2J8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9N2J8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9N2J8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9N2J8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9N2J8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9N2J8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9N2J8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9N2J8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9N2J8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9N2J8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9N2J8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9N2J8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9N2J8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9N2J8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9N2J8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9N2J8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9N2J8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9N2J8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9N2J8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9N2J8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9N2J8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9N2J8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9N2J8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9N2J8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9N2J8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9N2J8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9N2J8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9N2J8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9N2J8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9N2J8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9N2J8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9N2J8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms