Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU5

PREB, Prolactin regulatory element-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREBQ9HCU5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PREBQ9HCU5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PREBQ9HCU5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PREBQ9HCU5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PREBQ9HCU5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PREBQ9HCU5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PREBQ9HCU5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PREBQ9HCU5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PREBQ9HCU5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PREBQ9HCU5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PREBQ9HCU5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PREBQ9HCU5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PREBQ9HCU5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PREBQ9HCU5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PREBQ9HCU5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PREBQ9HCU5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PREBQ9HCU5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PREBQ9HCU5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PREBQ9HCU5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PREBQ9HCU5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PREBQ9HCU5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PREBQ9HCU5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PREBQ9HCU5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PREBQ9HCU5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PREBQ9HCU5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PREBQ9HCU5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PREBQ9HCU5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PREBQ9HCU5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PREBQ9HCU5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PREBQ9HCU5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PREBQ9HCU5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PREBQ9HCU5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PREBQ9HCU5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PREBQ9HCU5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PREBQ9HCU5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PREBQ9HCU5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PREBQ9HCU5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PREBQ9HCU5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PREBQ9HCU5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PREBQ9HCU5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PREBQ9HCU5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PREBQ9HCU5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PREBQ9HCU5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PREBQ9HCU5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PREBQ9HCU5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PREBQ9HCU5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PREBQ9HCU5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PREBQ9HCU5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PREBQ9HCU5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PREBQ9HCU5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PREBQ9HCU5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PREBQ9HCU5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PREBQ9HCU5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PREBQ9HCU5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PREBQ9HCU5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PREBQ9HCU5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PREBQ9HCU5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PREBQ9HCU5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PREBQ9HCU5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PREBQ9HCU5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PREBQ9HCU5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PREBQ9HCU5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PREBQ9HCU5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PREBQ9HCU5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PREBQ9HCU5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PREBQ9HCU5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PREBQ9HCU5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PREBQ9HCU5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PREBQ9HCU5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PREBQ9HCU5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PREBQ9HCU5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PREBQ9HCU5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PREBQ9HCU5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PREBQ9HCU5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PREBQ9HCU5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PREBQ9HCU5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PREBQ9HCU5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PREBQ9HCU5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PREBQ9HCU5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PREBQ9HCU5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PREBQ9HCU5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PREBQ9HCU5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PREBQ9HCU5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PREBQ9HCU5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PREBQ9HCU5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PREBQ9HCU5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PREBQ9HCU5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PREBQ9HCU5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PREBQ9HCU5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PREBQ9HCU5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PREBQ9HCU5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PREBQ9HCU5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PREBQ9HCU5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PREBQ9HCU5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PREBQ9HCU5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PREBQ9HCU5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PREBQ9HCU5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PREBQ9HCU5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PREBQ9HCU5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PREBQ9HCU5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms