Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLXNA4Q9HCM2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLXNA4Q9HCM2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLXNA4Q9HCM2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLXNA4Q9HCM2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PLXNA4Q9HCM2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLXNA4Q9HCM2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLXNA4Q9HCM2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLXNA4Q9HCM2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLXNA4Q9HCM2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PLXNA4Q9HCM2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PLXNA4Q9HCM2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLXNA4Q9HCM2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLXNA4Q9HCM2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLXNA4Q9HCM2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLXNA4Q9HCM2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLXNA4Q9HCM2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLXNA4Q9HCM2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLXNA4Q9HCM2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PLXNA4Q9HCM2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PLXNA4Q9HCM2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PLXNA4Q9HCM2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PLXNA4Q9HCM2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PLXNA4Q9HCM2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PLXNA4Q9HCM2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PLXNA4Q9HCM2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PLXNA4Q9HCM2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PLXNA4Q9HCM2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PLXNA4Q9HCM2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PLXNA4Q9HCM2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PLXNA4Q9HCM2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PLXNA4Q9HCM2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PLXNA4Q9HCM2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PLXNA4Q9HCM2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PLXNA4Q9HCM2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PLXNA4Q9HCM2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PLXNA4Q9HCM2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PLXNA4Q9HCM2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PLXNA4Q9HCM2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PLXNA4Q9HCM2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PLXNA4Q9HCM2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PLXNA4Q9HCM2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PLXNA4Q9HCM2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PLXNA4Q9HCM2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PLXNA4Q9HCM2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PLXNA4Q9HCM2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PLXNA4Q9HCM2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PLXNA4Q9HCM2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PLXNA4Q9HCM2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PLXNA4Q9HCM2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PLXNA4Q9HCM2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLXNA4Q9HCM2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLXNA4Q9HCM2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLXNA4Q9HCM2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLXNA4Q9HCM2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLXNA4Q9HCM2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLXNA4Q9HCM2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLXNA4Q9HCM2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLXNA4Q9HCM2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLXNA4Q9HCM2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PLXNA4Q9HCM2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PLXNA4Q9HCM2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PLXNA4Q9HCM2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PLXNA4Q9HCM2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
PLXNA4Q9HCM2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PLXNA4Q9HCM2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PLXNA4Q9HCM2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLXNA4Q9HCM2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLXNA4Q9HCM2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLXNA4Q9HCM2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PLXNA4Q9HCM2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PLXNA4Q9HCM2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PLXNA4Q9HCM2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PLXNA4Q9HCM2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PLXNA4Q9HCM2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PLXNA4Q9HCM2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PLXNA4Q9HCM2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PLXNA4Q9HCM2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PLXNA4Q9HCM2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PLXNA4Q9HCM2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PLXNA4Q9HCM2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PLXNA4Q9HCM2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PLXNA4Q9HCM2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PLXNA4Q9HCM2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PLXNA4Q9HCM2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PLXNA4Q9HCM2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PLXNA4Q9HCM2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PLXNA4Q9HCM2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PLXNA4Q9HCM2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PLXNA4Q9HCM2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PLXNA4Q9HCM2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PLXNA4Q9HCM2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PLXNA4Q9HCM2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PLXNA4Q9HCM2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PLXNA4Q9HCM2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PLXNA4Q9HCM2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PLXNA4Q9HCM2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PLXNA4Q9HCM2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PLXNA4Q9HCM2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PLXNA4Q9HCM2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms