Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC97

GPR35, G-protein coupled receptor 35, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR35Q9HC97 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPR35Q9HC97 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPR35Q9HC97 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GPR35Q9HC97 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPR35Q9HC97 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPR35Q9HC97 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPR35Q9HC97 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPR35Q9HC97 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GPR35Q9HC97 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPR35Q9HC97 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPR35Q9HC97 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPR35Q9HC97 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPR35Q9HC97 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPR35Q9HC97 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPR35Q9HC97 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPR35Q9HC97 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPR35Q9HC97 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GPR35Q9HC97 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPR35Q9HC97 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPR35Q9HC97 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPR35Q9HC97 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPR35Q9HC97 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPR35Q9HC97 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPR35Q9HC97 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPR35Q9HC97 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPR35Q9HC97 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPR35Q9HC97 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPR35Q9HC97 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GPR35Q9HC97 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPR35Q9HC97 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GPR35Q9HC97 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPR35Q9HC97 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GPR35Q9HC97 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPR35Q9HC97 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPR35Q9HC97 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GPR35Q9HC97 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GPR35Q9HC97 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GPR35Q9HC97 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GPR35Q9HC97 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPR35Q9HC97 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPR35Q9HC97 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPR35Q9HC97 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPR35Q9HC97 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPR35Q9HC97 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GPR35Q9HC97 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPR35Q9HC97 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPR35Q9HC97 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPR35Q9HC97 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPR35Q9HC97 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPR35Q9HC97 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPR35Q9HC97 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPR35Q9HC97 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GPR35Q9HC97 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GPR35Q9HC97 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPR35Q9HC97 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GPR35Q9HC97 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPR35Q9HC97 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPR35Q9HC97 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GPR35Q9HC97 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GPR35Q9HC97 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPR35Q9HC97 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GPR35Q9HC97 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPR35Q9HC97 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPR35Q9HC97 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPR35Q9HC97 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GPR35Q9HC97 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPR35Q9HC97 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPR35Q9HC97 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPR35Q9HC97 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPR35Q9HC97 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPR35Q9HC97 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GPR35Q9HC97 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPR35Q9HC97 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPR35Q9HC97 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPR35Q9HC97 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPR35Q9HC97 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPR35Q9HC97 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPR35Q9HC97 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPR35Q9HC97 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPR35Q9HC97 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPR35Q9HC97 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPR35Q9HC97 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPR35Q9HC97 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPR35Q9HC97 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPR35Q9HC97 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPR35Q9HC97 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPR35Q9HC97 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPR35Q9HC97 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPR35Q9HC97 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPR35Q9HC97 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPR35Q9HC97 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPR35Q9HC97 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPR35Q9HC97 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPR35Q9HC97 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPR35Q9HC97 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GPR35Q9HC97 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPR35Q9HC97 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPR35Q9HC97 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPR35Q9HC97 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPR35Q9HC97 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms